RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233331.11

INO80B-201, Transcript of INO80 complex subunit B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene INO80B, Length 1,261 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80B-201ENST00000233331 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 TMEM40Q8WWA1 233 aa34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 FTHL17Q9BXU8 183 aa34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 RGL1Q9NZL6 768 aa34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 INSL6Q9Y581 213 aa34.38■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 GPR32O75388 356 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 RPS6KA5O75582 802 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CYP4A11Q02928 519 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ZNF174Q15697 407 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 TTC38Q5R3I4 469 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 LINC01599Q8WXQ3 324 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CEP89Q96ST8 783 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 YME1L1Q96TA2 773 aa34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP34.37■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 COL6A3P12111 3177 aa34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ENPP3O14638 875 aa34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 SPRED2Q7Z698 418 aa34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ARNTL2Q8WYA1 636 aa34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 SMC3Q9UQE7 1217 aa34.36■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 C4orf19Q8IY42 314 aa34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ERVK-5Q9HDB9 667 aa34.35■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 LINC01553A4QN01 128 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 TRAPPC10P48553 1259 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ADGRE1Q14246 886 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ODR4Q5SWX8 454 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 SCLT1Q96NL6 688 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CYP26B1Q9NR63 512 aa34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP34.34■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 OR52Z1P0C646 297 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 IGFBP4P22692 258 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 NPEPPSP55786 919 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 DRP2Q13474 957 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 TPH2Q8IWU9 490 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CEP170P1Q96L14 293 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 ADAMTS10Q9H324 1103 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 TMX1Q9H3N1 280 aa34.33■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 CHD7Q9P2D1 2997 aa34.32■■■■□ 3.09
INO80B-201ENST00000233331 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 EPOPA6NHQ4 379 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 POTEMA6NI47 508 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 RFXAPO00287 272 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 MAFO75444 373 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 YWHABP31946 246 aaKnown RBP34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 GPC3P51654 580 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 MCTP1Q6DN14 999 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 FAM228AQ86W67 206 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ZNF710Q8N1W2 664 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 NEK9Q8TD19 979 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 MTUS1Q9ULD2 1270 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa34.32■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 GPR182O15218 404 aa34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 SLITRK3O94933 977 aa34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 DNM2P50570 870 aa34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 NBR1Q14596 966 aa34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP34.31■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 H3BQV1 296 aa34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 OTUD6AQ7L8S5 288 aa34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 NLRP7Q8WX94 980 aa34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 PPME1Q9Y570 386 aa34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 TTC3P53804 2025 aa34.3■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 SLC7A3Q8WY07 619 aa34.29■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 HSD17B14Q9BPX1 270 aa34.29■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 MGEA5O60502 916 aa34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ERVK-21P61565 698 aa34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 XKR9Q5GH70 373 aa34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 COL4A6Q14031 1691 aa34.28■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 DENND3A2RUS2 1198 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ZBTB39O15060 712 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 RFC5P40937 340 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 TECP42680 631 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 NPAS4Q8IUM7 802 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ADAM2Q99965 735 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 ARID2Q68CP9 1835 aa34.27■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 LYPLA2O95372 231 aa34.26■■■■□ 3.08
INO80B-201ENST00000233331 DARSP14868 501 aaKnown RBP34.26■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 80 ms