RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460766.5

IMP4-208, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene IMP4, Length 2,379 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-208ENST00000460766 EPB41L5Q9HCM4 733 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 OLFML3Q9NRN5 406 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 NAGPAQ9UK23 515 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 ATRNL1Q5VV63 1379 aa22.4■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 NMT1P30419 496 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 UBXN2AP68543 259 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 GJB7Q6PEY0 223 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 FOXR1Q6PIV2 292 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 OTOP1Q7RTM1 612 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 RUFY1Q96T51 708 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 GOLPH3Q9H4A6 298 aa22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.18
IMP4-208ENST00000460766 KCNK3O14649 394 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZBTB39O15060 712 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GAP43P17677 238 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PTPROQ16827 1216 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CAVIN3Q969G5 261 aa22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SCN9AQ15858 1988 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 BTNL10A8MVZ5 291 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TGFB1I1O43294 461 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FLOT1O75955 427 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SLITRK3O94933 977 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 RPS6KA1Q15418 735 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SIX2Q9NPC8 291 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 NFU1Q9UMS0 254 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TCP10L2B9ZVM9 353 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TULP2O00295 520 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 HSF2BPO75031 334 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ACER1Q8TDN7 264 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TUFT1Q9NNX1 390 aa22.38■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CHRNA5P30532 468 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 KSR1Q8IVT5 923 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GDF3Q9NR23 364 aa22.37■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 APBA3O96018 575 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PRKCIP41743 596 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 VPS36Q86VN1 386 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FAM186BQ8IYM0 893 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 OPA1O60313 960 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PSMD10O75832 226 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 POLR2MP0CAP2 368 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 STYK1Q6J9G0 422 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 C1orf186Q6ZWK4 172 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 KLHL7Q8IXQ5 586 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 USP38Q8NB14 1042 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PARVGQ9HBI0 331 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa22.36■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GOLGA8KD6RF30 607 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GAS7O60861 476 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 JAM2P57087 298 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PAK2Q13177 524 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ALS2CLQ60I27 953 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SH3GL2Q99962 352 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 LCMT1Q9UIC8 334 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FBXL5Q9UKA1 691 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 SHTN1A0MZ66 631 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CLRN2A0PK11 232 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GFPT2O94808 682 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 KIF4AO95239 1232 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FAM153BP0C7A2 387 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TRAF1Q13077 416 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PPFIA1Q13136 1202 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 COG2Q14746 738 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FAM153CQ494X1 144 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 KCTD17Q8N5Z5 321 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TMOD2Q9NZR1 351 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.35■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TNNC1P63316 161 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PPP2R5CQ13362 524 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 NNTQ13423 1086 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GOPCQ9HD26 462 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GUCY2FP51841 1108 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 PRELPP51888 382 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 LRRC57Q8N9N7 239 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 BORCS6Q96GS4 357 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 RSPH14Q9UHP6 348 aa22.34■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 TMCO5BA8MYB1 307 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 RAD51CO43502 376 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 CEP104O60308 925 aa22.33■■□□□ 1.17
IMP4-208ENST00000460766 H2AFZP0C0S5 128 aa22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.9 ms