RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 TSPY2A6NKD2 308 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP3A4P08684 503 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 DDB1Q16531 1140 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CYP1B1Q16678 543 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 LETM2Q2VYF4 491 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC30A10Q6XR72 485 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TPCN2Q8NHX9 752 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD9Q9H257 536 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 MTA2O94776 668 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 RPA1P27694 616 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNTL6Q49A17 601 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MFSD5Q6N075 450 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf186Q6ZWK4 172 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC9A9Q8IVB4 645 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TOMM22Q9NS69 142 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 JAG2Q9Y219 1238 aa3.99□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 POTEBQ6S5H4 581 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R14Q9NYV8 317 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 WHAMMQ8TF30 809 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNN1Q92952 543 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 COL4A5P29400 1685 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ERICH2A1L162 156 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 KRT35Q92764 455 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 NR1D1P20393 614 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 EYA3Q99504 573 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 VCPKMTQ9H867 229 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 UMODL1Q5DID0 1318 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD63C9JTQ0 380 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR1B10O60218 316 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 GUCY2DQ02846 1103 aa3.98□□□□□ -1.77
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PGGT1B-203ENST00000419445 RIPK1Q13546 671 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 KCTD16Q68DU8 428 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 MAB21L3Q8N8X9 362 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPTQ96BT3 561 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD2Q9GZV1 360 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 EPB41L5Q9HCM4 733 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRC4Q9NPP4 1024 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa3.98□□□□□ -1.77
PGGT1B-203ENST00000419445 COQ4Q9Y3A0 265 aa3.98□□□□□ -1.77
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