RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491260.2

C1orf143-202, Transcript of chromosome 1 open reading frame 143 (putative), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene C1orf143, Length 813 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf143-202ENST00000491260 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 NOP56O00567 594 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SUSD5O60279 629 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SLC43A3Q8NBI5 491 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 BTN2A2Q8WVV5 523 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PPP1R14AQ96A00 147 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 GMLQ99445 158 aa7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ADAMTS20P59510 1910 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TRIM13O60858 407 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 DDAH1O94760 285 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 INHBBP09529 407 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ATF2P15336 505 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 DDB1Q16531 1140 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 FXNQ16595 210 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ZNF827Q17R98 1081 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 INF2Q27J81 1249 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SV2CQ496J9 727 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TMEM151BQ8IW70 566 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PLEKHO2Q8TD55 490 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 KCNC2Q96PR1 638 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 POGKQ9P215 609 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PAPPAQ13219 1627 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa7□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 NPHS1O60500 1241 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 GJB6O95452 261 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CAPNS1P04632 268 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 LIMS1P48059 325 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CCDC103Q8IW40 242 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 NETO2Q8NC67 525 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 BCAS3Q9H6U6 928 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CRB1P82279 1406 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa6.99□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 FUCA1P04066 466 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ASGR2P07307 311 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 BMP7P18075 431 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 VMACQ2NL98 169 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TSPAN17Q96FV3 270 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PWWP2AQ96N64 755 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 RAPGEFL1Q9UHV5 662 aa6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 AKAP12Q02952 1782 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ADCY9O60503 1353 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CPDO75976 1380 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 NTRK1P04629 796 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SCG5P05408 212 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PFKLP17858 780 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 HOXC12P31275 282 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 MC3RP41968 323 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 WWC2Q6AWC2 1192 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 ANKS3Q6ZW76 656 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 CABP7Q86V35 215 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 C20orf173Q96LM9 149 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 RNF38Q9H0F5 515 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 SIT1Q9Y3P8 196 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 WNK3Q9BYP7 1800 aa6.97□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.96□□□□□ -1.29
C1orf143-202ENST00000491260 BCL9O00512 1426 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 KLF4O43474 513 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 HOXA5P20719 270 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 POLD1P28340 1107 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 PMLP29590 882 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 PRELPP51888 382 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 SLC10A6Q3KNW5 377 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 DENND5AQ6IQ26 1287 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 USP33Q8TEY7 942 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 PEX11GQ96HA9 241 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 LRP2BPQ9P2M1 347 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 USP19O94966 1318 aa6.96□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 GCP02774 474 aa6.95□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
C1orf143-202ENST00000491260 NCAM1P13591 858 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 150.5 ms