RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476842.1

SMIM4-202, Transcript of small integral membrane protein 4, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene SMIM4, Length 522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM4-202ENST00000476842 CLTBP09497 229 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 ABHD15Q6UXT9 468 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 HSCBQ8IWL3 235 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 ETNPPLQ8TBG4 499 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 FAM20AQ96MK3 541 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 PDLIM7Q9NR12 457 aa20.15■□□□□ 0.82
SMIM4-202ENST00000476842 KIF28PB7ZC32 967 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 H3BQV1 296 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TBX3O15119 743 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PSMD10O75832 226 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 CHMP4BP1P59074 171 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 KRT76Q01546 638 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 FAM47CQ5HY64 1035 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 C7orf31Q8N865 590 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PCYT2Q99447 389 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 KCNMB3Q9NPA1 279 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TMEM39AQ9NV64 488 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM43BA6NCK2 446 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 KIAA0355O15063 1070 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 B4GALT4O60513 344 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GAS7O60861 476 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TEKT3Q9BXF9 490 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.13■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 MYH7BA7E2Y1 1941 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 EMSYQ7Z589 1322 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SYN1P17600 705 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PDCP20941 246 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRAPPC10P48553 1259 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 B3GNT9Q6UX72 402 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRIM50Q86XT4 487 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GLG1Q92896 1179 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GJA10Q969M2 543 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 AZI2Q9H6S1 392 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ERAP1Q9NZ08 941 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TBX21Q9UL17 535 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa20.12■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 WNT7AO00755 349 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 BAG4O95429 457 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 STAT5BP51692 787 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 MCTP1Q6DN14 999 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 POTEDQ86YR6 584 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 HAS1Q92839 578 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 UNC45AQ9H3U1 944 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 RNPEPQ9H4A4 650 aa20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 WDR64B1ANS9 1081 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 MARCH6O60337 910 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PSAPP07602 524 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ATP2B1P20020 1258 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SFNP31947 248 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SLC26A2P50443 739 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PTGISQ16647 500 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 FAM160B1Q5W0V3 765 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SWSAP1Q6NVH7 229 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 RDM1Q8NG50 284 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 AFAP1L1Q8TED9 768 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 DISC1Q9NRI5 854 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa20.1■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 BACH1O14867 736 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 HOXC8P31273 242 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 JAK3P52333 1124 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ZNF302Q9NR11 478 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 SAMM50Q9Y512 469 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 ALPK3Q96L96 1907 aa20.09■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 C17orf102A2RUQ5 167 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 NEMFO60524 1076 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 TIMP1P01033 207 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 GNAT1P11488 350 aa20.08■□□□□ 0.81
SMIM4-202ENST00000476842 RAG1P15918 1043 aa20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms