RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 CCDC40Q4G0X9 1142 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 CCDC65Q8IXS2 484 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 TSPYL1Q9H0U9 437 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 FAM204AQ9H8W3 233 aa28.57■■■□□ 2.16
OPN3-204ENST00000469376 SERPINA10Q9UK55 444 aa28.57■■■□□ 2.16
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OPN3-204ENST00000469376 SPATA4Q8NEY3 305 aa28.55■■■□□ 2.16
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OPN3-204ENST00000469376 TLR10Q9BXR5 811 aa28.5■■■□□ 2.15
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OPN3-204ENST00000469376 SLFN12Q8IYM2 578 aa28.49■■■□□ 2.15
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OPN3-204ENST00000469376 SLC16A2P36021 539 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 MCTP2Q6DN12 878 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 AGPSO00116 658 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 TLR2O60603 784 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 EPHB4P54760 987 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 GPR162Q16538 588 aa28.48■■■□□ 2.15
OPN3-204ENST00000469376 EMBQ6PCB8 327 aa28.48■■■□□ 2.15
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