RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429299.2

LTB-210, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 897 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-210ENST00000429299 STXBP3O00186 592 aa22.47■■□□□ 1.19
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LTB-210ENST00000429299 NEDD9Q14511 834 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 STAG2Q8N3U4 1231 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 SNX27Q96L92 541 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 BCAS3Q9H6U6 928 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 CD207Q9UJ71 328 aa22.47■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
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LTB-210ENST00000429299 ADAM15Q13444 863 aa22.46■■□□□ 1.19
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LTB-210ENST00000429299 PRRX2Q99811 253 aa22.46■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 PLVAPQ9BX97 442 aa22.46■■□□□ 1.19
LTB-210ENST00000429299 STAM2O75886 525 aa22.45■■□□□ 1.18
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LTB-210ENST00000429299 TTC22Q5TAA0 569 aa22.45■■□□□ 1.18
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LTB-210ENST00000429299 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.43■■□□□ 1.18
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LTB-210ENST00000429299 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.4■■□□□ 1.18
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LTB-210ENST00000429299 SEMA3FQ13275 785 aa22.39■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 SEC23AQ15436 765 aa22.39■■□□□ 1.17
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LTB-210ENST00000429299 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
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LTB-210ENST00000429299 DSCC1Q9BVC3 393 aa22.39■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.39■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa22.39■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 ZXDAP98168 799 aa22.38■■□□□ 1.17
LTB-210ENST00000429299 MGAT3Q09327 533 aa22.38■■□□□ 1.17
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