RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299633.6

HDGFL3-201, Transcript of HDGF like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HDGFL3, Length 12,733 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3-201ENST00000299633 DNAJC13O75165 2243 aa12.01□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 CHRNA2Q15822 529 aa12.01□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 KRT77Q7Z794 578 aa12.01□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 F8W031 263 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 RASSF9O75901 435 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 UNC45BQ8IWX7 931 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX14Q8IWB6 1497 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 WDR91A4D1P6 747 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE9AO76083 593 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 IL10P22301 178 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRAPPC10P48553 1259 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PNOCQ13519 176 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 KLHL12Q53G59 568 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TAF8Q7Z7C8 310 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM167BQ9BTA0 163 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRPC7Q9HCX4 862 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF212Q9UDV6 495 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ALDH1L1O75891 902 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PICALMQ13492 652 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ACAD11Q709F0 780 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SERPINB3P29508 390 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 IL15P40933 162 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 RAD23BP54727 409 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 KRT76Q01546 638 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 NNTQ13423 1086 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TTBK2Q6IQ55 1244 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MPP4Q96JB8 637 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 BACH1O14867 736 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MDM1Q8TC05 714 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TMOD4Q9NZQ9 345 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 LMBR1LQ6UX01 489 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SNX19Q92543 992 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PARVGQ9HBI0 331 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 OLFML3Q9NRN5 406 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SBNO1A3KN83 1393 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 AP1S2P56377 157 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 STX12Q86Y82 276 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 NUDCD1Q96RS6 583 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE5AO76074 875 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TMCC1O94876 653 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MAGEA1P43355 309 aa12□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 A0A087WWV3 80 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SLC27A2O14975 620 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PDE4DQ08499 809 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TERB1Q8NA31 727 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 BATF3Q9NR55 127 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 JAG2Q9Y219 1238 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 BCAP31P51572 246 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 MTERF3Q96E29 417 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 BLOC1S6Q9UL45 172 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DEPDC7Q96QD5 511 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ECT2Q9H8V3 914 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 POTEFA5A3E0 1075 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 NFIBO00712 420 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 RTTNQ86VV8 2226 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 GCNT3O95395 438 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PPP1R14BQ96C90 147 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 RFX1P22670 979 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRPC6Q9Y210 931 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DDHD1Q8NEL9 900 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ZMYND12Q9H0C1 365 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SNX25Q9H3E2 840 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 CHMP2BQ9UQN3 213 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 VAMP4O75379 141 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 PMLP29590 882 aa11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SPARCL1Q14515 664 aa11.98□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 ZNF174Q15697 407 aa11.98□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 TRIM69Q86WT6 500 aa11.98□□□□□ -0.49
HDGFL3-201ENST00000299633 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.2 ms