RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589146.5

CAPNS1-207, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CAPNS1, Length 578 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-207ENST00000589146 EPHA7Q15375 998 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEBQ6S5H4 581 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 DNERQ8NFT8 737 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 IWS1Q96ST2 819 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 HSD3B7Q9H2F3 369 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 RBPJLQ9UBG7 517 aa25.49■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 LCTP09848 1927 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MAFGO15525 162 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX15O43143 795 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CELF2O95319 508 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF75DP51815 510 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 GPRASP2Q96D09 838 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PNMA3Q9UL41 463 aa25.48■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MTMR1Q13613 665 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 HS1BP3Q53T59 392 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CHADLQ6NUI6 762 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC13DQ70J99 1090 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 NEK9Q8TD19 979 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MED15Q96RN5 788 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 UNC45AQ9H3U1 944 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 TBC1D22BQ9NU19 505 aa25.47■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 PLA2G4BP0C869 781 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 CDC25BP30305 580 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ASIC1P78348 528 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD23Q86SG2 305 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 NLRX1Q86UT6 975 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 DNM3Q9UQ16 869 aa25.46■■□□□ 1.67
CAPNS1-207ENST00000589146 E9PMD0 336 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PPP1R2P41236 205 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SLC12A3P55017 1021 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PLCB2Q00722 1185 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SPRYD7Q5W111 196 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ADSSL1Q8N142 457 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SHCBP1Q8NEM2 672 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 TRIM5Q9C035 493 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EXOC1Q9NV70 894 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 TRPM7Q96QT4 1865 aa25.45■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEFA5A3E0 1075 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SLITRK3O94933 977 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EHHADHQ08426 723 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SPATA1Q5VX52 437 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CST9Q5W186 159 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 POTEGQ6S5H5 508 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ANKRD35Q8N283 1001 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SYT2Q8N9I0 419 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.44■■□□□ 1.66
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CAPNS1-207ENST00000589146 TXNRD2Q9NNW7 524 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 RWDD2AQ9UIY3 292 aa25.44■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PEX10O60683 326 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EYA4O95677 639 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ZNF18P17022 549 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PDE4DQ08499 809 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMD2Q13200 908 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NCAPG2Q86XI2 1143 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DDX12PQ92771 950 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CDHR1Q96JP9 859 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 GDAQ9Y2T3 454 aa25.43■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CYP11B2P19099 503 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ERCC3P19447 782 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PRCPP42785 496 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 CCL15Q16663 113 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 FAM133AQ8N9E0 248 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DYDC2Q96IM9 177 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SENP7Q9BQF6 1050 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 MROH8Q9H579 483 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 FANCLQ9NW38 375 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 RGL1Q9NZL6 768 aa25.42■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 BTBD19C9JJ37 291 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 EDNRBP24530 442 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ICAM3P32942 547 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PSMC6P62333 389 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 PAK1Q13153 545 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 STIM1Q13586 685 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 Q3C1V9 767 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 RDM1Q8NG50 284 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa25.41■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 ASTN1O14525 1302 aa25.4■■□□□ 1.66
CAPNS1-207ENST00000589146 NFASCO94856 1347 aa25.4■■□□□ 1.66
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