RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512611.5

RAPGEF6-211, Transcript of Rap guanine nucleotide exchange factor 6, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RAPGEF6, Length 3,683 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC40A1Q9NP59 571 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLC4Q9NSK0 619 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 HAUS2Q9NVX0 235 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ITGB4P16144 1822 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRAF5O00463 557 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 DAPK3O43293 454 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASSF9O75901 435 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 PTK2Q05397 1052 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CNNM4Q6P4Q7 775 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP38Q8NB14 1042 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZMYND12Q9H0C1 365 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMBIM4Q9HC24 238 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.53□□□□□ -1.2
RAPGEF6-211ENST00000512611 USP17L5A8MUK1 530 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 KIAA0754O94854 1291 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CASP5P51878 434 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 E2F5Q15329 346 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE2SQ16763 222 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MTMR9Q96QG7 549 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 FBXL5Q9UKA1 691 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 E9PMD0 336 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 KCNQ2O43526 872 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP104O60308 925 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM107AO95990 144 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 TNFRSF8P28908 595 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SFMBT2Q5VUG0 894 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC91Q7Z6B0 441 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 NEK8Q86SG6 692 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 FAM114A1Q8IWE2 563 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ANKS1AQ92625 1134 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 VCPKMTQ9H867 229 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SH3GLB2Q9NR46 395 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 GGT7Q9UJ14 662 aa7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SHBGP04278 402 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 PAK2Q13177 524 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 AADACL2Q6P093 401 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 UNC13DQ70J99 1090 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CEP57Q86XR8 500 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 RAPGEF5Q92565 580 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 DNAJC19Q96DA6 116 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 DPH5Q9H2P9 285 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 TMEM59LQ9UK28 342 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 DLEC1Q9Y238 1755 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 TTI1O43156 1089 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYL1P05976 194 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYBP10242 640 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 RASA1P20936 1047 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 PRPHP41219 470 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC18A3Q16572 532 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 DGKHQ86XP1 1220 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 METTL13Q8N6R0 699 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 BCS1LQ9Y276 419 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 FOXO6A8MYZ6 492 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 POLD1P28340 1107 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 UBE4AQ14139 1066 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CALCRLQ16602 461 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 ZCWPW2Q504Y3 356 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SLC30A10Q6XR72 485 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 TRIM51Q9BSJ1 452 aa7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 F8W031 263 aaPredicted RBP7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 SERPING1P05155 500 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 CDC25CP30307 473 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 KLHL30Q0D2K2 578 aa7.5□□□□□ -1.21
RAPGEF6-211ENST00000512611 COASYQ13057 564 aa7.5□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms