RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 MYH10P35580 1976 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 EPHB6O15197 1021 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GFPT2O94808 682 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 PDHBP11177 359 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CLK2P49760 499 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 COASYQ13057 564 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FAM83BQ5T0W9 1011 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 IQCKQ8N0W5 287 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 DNAJC19Q96DA6 116 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 PBKQ96KB5 322 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM66O15016 1216 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 KCNMA1Q12791 1236 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CUL1Q13616 776 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FAM182BQ5T319 152 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TXNRD3Q86VQ6 643 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FMNL3Q8IVF7 1028 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CEP95Q96GE4 821 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TRERF1Q96PN7 1200 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GRIN2DO15399 1336 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FRMD3A2A2Y4 597 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GOLGA8HP0CJ92 632 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MYBP10242 640 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SLC1A4P43007 532 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 BAG6P46379 1132 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CFAP58Q5T655 872 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FAM196AQ6ZSG2 479 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CUL5Q93034 780 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MTMR8Q96EF0 704 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MTMR4Q9NYA4 1195 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 INTUQ9ULD6 942 aa18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TAF1LQ8IZX4 1826 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC37AA6NMS7 1700 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 ZMYND10O75800 440 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 USP8P40818 1118 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 NOP2P46087 812 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 BICDL1Q6ZP65 573 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SLC44A5Q8NCS7 719 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TANGO6Q9C0B7 1094 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 PANK4Q9NVE7 773 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TMEM59LQ9UK28 342 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 LY75O60449 1722 aa18.54■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TRAF5O00463 557 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 NOL4O94818 638 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 USP11P51784 963 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 RHBDL3P58872 404 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 RASSF7Q02833 373 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 DIXDC1Q155Q3 683 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CLUL1Q15846 466 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 ASIC2Q16515 512 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FOXR1Q6PIV2 292 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TMC4Q7Z404 712 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 FRMD5Q7Z6J6 570 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 LMBR1Q8WVP7 490 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TAF4BQ92750 862 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 MBOAT7Q96N66 472 aa18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC188H7C350 402 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 TBX3O15119 743 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CETN3O15182 167 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SLC37A4O43826 429 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 CYP3A7P24462 503 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 PRKCIP41743 596 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GNGT1P63211 74 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SPDYCQ5MJ68 293 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 SLFN12Q8IYM2 578 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 ACTRT1Q8TDG2 376 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 LRRC45Q96CN5 670 aa18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP18.52■□□□□ 0.56
HCLS1-202ENST00000428394 USP17L5A8MUK1 530 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-202ENST00000428394 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-202ENST00000428394 KCNQ2O43526 872 aa18.51■□□□□ 0.55
HCLS1-202ENST00000428394 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.2 ms