RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625810.2

ATG4B-226, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene ATG4B, Length 370 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-226ENST00000625810 MTA3Q9BTC8 594 aa22.18■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CCDC69A6NI79 296 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 GGPS1O95749 300 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 ZNF286BP0CG31 522 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 TGFB3P10600 412 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 IGFBP4P22692 258 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 MFSD10Q14728 455 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CELF3Q5SZQ8 465 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 MYSM1Q5VVJ2 828 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 TMEM87BQ96K49 555 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 MLXIPQ9HAP2 919 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 HDAC6Q9UBN7 1215 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 MUC3AQ02505 3323 aa22.17■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SLC27A2O14975 620 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 PPFIA4O75335 1185 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 GNAQP50148 359 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 KIAA0753Q2KHM9 967 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 AFAP1L1Q8TED9 768 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CUL5Q93034 780 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SLC9A7Q96T83 725 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 ANO2Q9NQ90 1003 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa22.16■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 F2P00734 622 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CA3P07451 260 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 UBA1P22314 1058 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SMARCA1P28370 1054 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 HSDL1Q3SXM5 330 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 GNPTABQ3T906 1256 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 CREB3L3Q68CJ9 461 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa22.15■■□□□ 1.14
ATG4B-226ENST00000625810 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SP2Q02086 613 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 GPNMBQ14956 572 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 TRANK1O15050 2925 aa22.14■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 TET1Q8NFU7 2136 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 HAS3O00219 553 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 STAM2O75886 525 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CALM1P0DP23 149 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CALM2P0DP24 149 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CALM3P0DP25 149 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SELPP16109 830 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 RBL2Q08999 1139 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 NECTIN1Q15223 517 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 LRRC8DQ7L1W4 858 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 HERC6Q8IVU3 1022 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 THEGQ9P2T0 379 aa22.13■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 BAIAP3O94812 1187 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.12■■□□□ 1.13
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ATG4B-226ENST00000625810 LIFRP42702 1097 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SLC12A7Q9Y666 1083 aa22.12■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 KIF28PB7ZC32 967 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 NOP56O00567 594 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 ARHGEF15O94989 841 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CKBP12277 381 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 KCNJ6P48051 423 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 PTK7Q13308 1070 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 NEDD9Q14511 834 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 RNF20Q5VTR2 975 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.11■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 FRMPD4Q14CM0 1322 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 PTPRSQ13332 1948 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 ICAM3P32942 547 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 ZNF200P98182 395 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CERS4Q9HA82 394 aa22.1■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 REV3LO60673 3130 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 EPOPA6NHQ4 379 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 H3BRB1 525 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 RFXAPO00287 272 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 FIBPO43427 364 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 NBNO60934 754 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CXCL10P02778 98 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 WDR5P61964 334 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 TAP1Q03518 808 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 HIC1Q14526 733 aa22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
ATG4B-226ENST00000625810 CYFIP1Q7L576 1253 aa22.09■■□□□ 1.13
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