RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442720.5

SGO1-209, Transcript of shugoshin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SGO1, Length 2,266 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1-209ENST00000442720 IKQ13123 557 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CCDC65Q8IXS2 484 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 GLIS3Q8NEA6 775 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 TRIM10Q9UDY6 481 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SIK3Q9Y2K2 1263 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ATRNL1Q5VV63 1379 aa21.51■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 FAM26FQ5R3K3 315 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 KIAA1328Q86T90 577 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SUPT20HQ8NEM7 779 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ATP8B1O43520 1251 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 GH2P01242 217 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 BMP3P12645 472 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CRYGNQ8WXF5 182 aa21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 POTEB3A0JP26 581 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 POTECB2RU33 542 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 FOSP01100 380 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 JAG1P78504 1218 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 POTEBQ6S5H4 581 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 MYO6Q9UM54 1294 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 TBX3O15119 743 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 MMP14P50281 582 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 USH1GQ495M9 461 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 Q4G0T1 1027 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 GPBP1Q86WP2 473 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PSMD14O00487 310 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 KRT86O43790 486 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 STAT3P40763 770 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PRR16Q569H4 304 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 BTNL9Q6UXG8 535 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 MMRN2Q9H8L6 949 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SPDYE3A6NKU9 549 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 MED24O75448 989 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 AMPD2Q01433 879 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 DMTNQ08495 405 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ZCWPW2Q504Y3 356 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 HAUS3Q68CZ6 603 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CSRNP1Q96S65 589 aa21.48■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 POTEB2H3BUK9 544 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 TRAF5O00463 557 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PPIP5K2O43314 1243 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CYP11B2P19099 503 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 EHBP1Q8NDI1 1231 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CCDC42Q96M95 316 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PLAGL2Q9UPG8 496 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.47■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 YDJCA8MPS7 323 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SREBF1P36956 1147 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ERMNQ8TAM6 284 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 TBC1D7Q9P0N9 293 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 TFR2Q9UP52 801 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CTAGE15A4D2H0 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 KIF20AO95235 890 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CTAGE8P0CG41 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CTAGE6Q86UF2 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CTAGE4Q8IX94 777 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 CEP63Q96MT8 703 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 ARFGAP3Q9NP61 516 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 STK24Q9Y6E0 443 aa21.46■■□□□ 1.03
SGO1-209ENST00000442720 KRT18P05783 430 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SLC12A3P55017 1021 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPIRE1Q08AE8 756 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 BRD3Q15059 726 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 UTP14CQ5TAP6 766 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 FAM20AQ96MK3 541 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 A0A1W2PRG0 241 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 EPHB6O15197 1021 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 SPA17Q15506 151 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CCDC40Q4G0X9 1142 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 CATSPER3Q86XQ3 398 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TANGO6Q9C0B7 1094 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 ZMYND15Q9H091 742 aa21.45■■□□□ 1.02
SGO1-209ENST00000442720 TMOD2Q9NZR1 351 aa21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.6 ms