RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397828.3

AGO3-204, Transcript of argonaute 3, RISC catalytic component, human

TSL 2 BASIC

Gene AGO3, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AGO3-204	ENST00000397828	DHX32	Q7L7V1	743 aa	Known RBP	28.66	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	DEFB128	Q7Z7B8	93 aa		28.66	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	TIFA	Q96CG3	184 aa		28.66	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	ZBBX	A8MT70	800 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	PFKM	P08237	780 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	FGD1	P98174	961 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	MFSD10	Q14728	455 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	SESTD1	Q86VW0	696 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	RASEF	Q8IZ41	740 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	28.65	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	TRIP12	Q14669	1992 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	PIK3CD	O00329	1044 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	F2	P00734	622 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	MRPS9	P82933	396 aa	Known RBP	28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	SP2	Q02086	613 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	KIAA0753	Q2KHM9	967 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	HSDL1	Q3SXM5	330 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	GDF6	Q6KF10	455 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	HEATR3	Q7Z4Q2	680 aa		28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	28.64	■■■□□ 2.18
AGO3-204	ENST00000397828	GBF1	Q92538	1859 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	DOCK5	Q9H7D0	1870 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	MEIS2	O14770	477 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	ZBTB43	O43298	467 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	PPFIA4	O75335	1185 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	HMGB1	P09429	215 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	RFC2	P35250	354 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	MYLIP	Q8WY64	445 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	INPP4A	Q96PE3	977 aa	Predicted RBP	28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	PBX4	Q9BYU1	374 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	MSRA	Q9UJ68	235 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		28.63	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	FIBP	O43427	364 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	ACTN1	P12814	892 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	RTN1	Q16799	776 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	PCNX4	Q63HM2	1172 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	CAGE1	Q8TC20	777 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	GTF2IRD1	Q9UHL9	959 aa		28.62	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	IQCF3	P0C7M6	154 aa		28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	PBX2	P40425	430 aa		28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	NEDD9	Q14511	834 aa		28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	RAB30	Q15771	203 aa		28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	ZNF576	Q9H609	170 aa		28.61	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	SPDYE3	A6NKU9	549 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	GOLGA8A	A7E2F4	631 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	HOXD8	P13378	290 aa	Predicted RBP	28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	FOSL2	P15408	326 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	ICAM3	P32942	547 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	NLRX1	Q86UT6	975 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		28.6	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	SPATA31C2	B4DYI2	1134 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	HAS3	O00219	553 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	UBE2S	Q16763	222 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		28.59	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	REC8	O95072	547 aa		28.58	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	METTL7B	Q6UX53	244 aa		28.58	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	28.58	■■■□□ 2.17
AGO3-204	ENST00000397828	NAPA	P54920	295 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	GRIN2C	Q14957	1233 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	28.57	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	VWCE	Q96DN2	955 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	EHMT1	Q9H9B1	1298 aa		28.57	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828		H3BRB1	525 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	LGALS2	P05162	132 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	SELP	P16109	830 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	SP4	Q02446	784 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	SEMA3F	Q13275	785 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	LRRC8D	Q7L1W4	858 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	C16orf70	Q9BSU1	422 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		28.56	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	CPA1	P15085	419 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	HSPA4	P34932	840 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	PTK7	Q13308	1070 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	CDHR1	Q96JP9	859 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	USP26	Q9BXU7	913 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		28.55	■■■□□ 2.16
AGO3-204	ENST00000397828	SLC28A3	Q9HAS3	691 aa		28.55	■■■□□ 2.16

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41 ms