RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557413.5

RPS6KL1-216, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene RPS6KL1, Length 2,425 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCT5P48643 541 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 RASSF7Q02833 373 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 C8orf74Q6P047 294 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 NOX5Q96PH1 765 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TLR10Q9BXR5 811 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.86■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 BAG3O95817 575 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTMR8Q96EF0 704 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 RUFY1Q96T51 708 aa22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 BUB1O43683 1085 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CALCRLQ16602 461 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 ALS2CLQ60I27 953 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 PDXDC1Q6P996 788 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 PNMA5Q96PV4 448 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC1A4P43007 532 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CAVIN3Q969G5 261 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 MTMR9Q96QG7 549 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 FAM107BQ9H098 131 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 EHD4Q9H223 541 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMEM260Q9NX78 707 aa22.84■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 HSF2BPO75031 334 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 EPB41P11171 864 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TNFRSF8P28908 595 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 GNGT1P63211 74 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 WDR66Q8TBY9 1149 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 BCAS4Q8TDM0 211 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 PIGSQ96S52 555 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 CFAP221Q4G0U5 840 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 EYA3Q99504 573 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 NYXQ9GZU5 481 aa22.83■■□□□ 1.25
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRIN2DO15399 1336 aa22.83■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 EBAG9O00559 213 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 GSTO1P78417 241 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMEM266Q2M3C6 531 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 HGSNATQ68CP4 663 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SMIM5Q71RC9 77 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 MS4A14Q96JA4 679 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 IRS2Q9Y4H2 1338 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 KCNQ2O43526 872 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTMPQ5BVD1 217 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TADA2BQ86TJ2 420 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAD54LQ92698 747 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 ARL8AQ96BM9 186 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSG101Q99816 390 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 EDEM3Q9BZQ6 932 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TSKSQ9UJT2 592 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.82■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 LRRC41Q15345 812 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 GRIK5Q16478 980 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 RABEP2Q9H5N1 569 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SHTN1A0MZ66 631 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 POTEMA6NI47 508 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC37A4O43826 429 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 CDK8P49336 464 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 KCNQ4P56696 695 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 PPP4CP60510 307 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 KCNMA1Q12791 1236 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 GLIS3Q8NEA6 775 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 DDX12PQ92771 950 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SETDB2Q96T68 719 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NLRC4Q9NPP4 1024 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SNED1Q8TER0 1413 aa22.81■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 IFT20Q8IY31 132 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 RAB34Q9BZG1 259 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 NNTQ13423 1086 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 TMC4Q7Z404 712 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 SNX29Q8TEQ0 813 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 ZIM3Q96PE6 472 aa22.8■■□□□ 1.24
RPS6KL1-216ENST00000557413 ESYT2A0FGR8 921 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.5 ms