RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537075.2

KCNS1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel modifier subfamily S member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNS1, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1-202ENST00000537075 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 CDC23Q9UJX2 597 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 PPIP5K2O43314 1243 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 TEX35Q5T0J7 233 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 NYAP2Q9P242 653 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 PSME4Q14997 1843 aa25.22■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 GUF1Q8N442 669 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 SGIP1Q9BQI5 828 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 MYO1AQ9UBC5 1043 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 DCAF4Q8WV16 495 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 DDX12PQ92771 950 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 PI4KBQ9UBF8 816 aa25.21■■□□□ 1.63
KCNS1-202ENST00000537075 CTAGE9A4FU28 777 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L15C9J2P7 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L11C9JVI0 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L18D6R9N7 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L22D6RA61 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L17D6RBQ6 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L19D6RCP7 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L20D6RJB6 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 HERVK_113P62684 666 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L24Q0WX57 530 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TATDN1Q6P1N9 297 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 USP17L6PQ6QN14 398 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 RETREG2Q8NC44 543 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 RABGGTAQ92696 567 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 GOLGA1Q92805 767 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 NUP58Q9BVL2 599 aa25.2■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM10Q9UDY6 481 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 HYIQ5T013 277 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SLFN13Q68D06 897 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 DNAJC19Q96DA6 116 aa25.19■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SLC1A4P43007 532 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SEPT2Q15019 361 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 FIGNQ5HY92 759 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ZBED6P86452 979 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 DMTNQ08495 405 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TUBB2AQ13885 445 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TUBB2BQ9BVA1 445 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ZMYND15Q9H091 742 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PCDHA12Q9UN75 941 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 CD2APQ9Y5K6 639 aa25.18■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 A0A1W2PQJ5 194 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TFRCP02786 760 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 IDEP14735 1019 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 CHMP4BP1P59074 171 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TMCO3Q6UWJ1 677 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC55Q6ZSA7 311 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC27Q9C0I9 530 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 KCNMB3Q9NPA1 279 aa25.17■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 RAD21O60216 631 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 MBOAT7Q96N66 472 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ANO3Q9BYT9 981 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 GLT8D2Q9H1C3 349 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 VPS33BQ9H267 617 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 MEIS2O14770 477 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 AMPD2Q01433 879 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 LRRC63Q05C16 580 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PSMD2Q13200 908 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 CRYGNQ8WXF5 182 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PARD6BQ9BYG5 372 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SERPINA10Q9UK55 444 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 SIK3Q9Y2K2 1263 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ABCB11O95342 1321 aa25.16■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 ICA1Q05084 483 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 COASYQ13057 564 aa25.15■■□□□ 1.62
KCNS1-202ENST00000537075 VWA3BQ502W6 1294 aa25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25 ms