RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399336.8

NOMO3-202, Transcript of NODAL modulator 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOMO3, Length 4,356 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3-202ENST00000399336 ZBTB22O15209 634 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 PLA2G4BP0C869 781 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 WDR44Q5JSH3 913 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 FAM71BQ8TC56 605 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 MED4Q9NPJ6 270 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 HDAC6Q9UBN7 1215 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 ASIC3Q9UHC3 531 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 IKBKGQ9Y6K9 419 aa20.14■□□□□ 0.82
NOMO3-202ENST00000399336 POLR2MP0CAP2 368 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 PTPAQ15257 358 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 POTEDQ86YR6 584 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC170Q8IYT3 715 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SYCE1Q8N0S2 351 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CHP1Q99653 195 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ST7Q9NRC1 585 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SORBS3O60504 671 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 FCER1AP12319 257 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ANKS4BQ8N8V4 417 aa20.14■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ORC4O43929 436 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CCDC91Q7Z6B0 441 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SH3GLB2Q9NR46 395 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 LRCH2Q5VUJ6 765 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 KIFAP3Q92845 792 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 BARHL2Q9NY43 387 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 RNF40O75150 1001 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 C12orf60Q5U649 245 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 RUFY4Q6ZNE9 571 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 METTL14Q9HCE5 456 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 USTQ9Y2C2 406 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 JRKLQ9Y4A0 524 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SFI1A8K8P3 1242 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 K7ENM7 598 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 INPP5BP32019 993 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF710Q8N1W2 664 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 TC2NQ8N9U0 490 aa20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 TDP2O95551 362 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SWAP70Q9UH65 585 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 STK24Q9Y6E0 443 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 GRM4Q14833 912 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CLEC10AQ8IUN9 316 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 AGXT2Q9BYV1 514 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 LRRN2O75325 713 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 HEXIM1O94992 359 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.12■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 E7EVH7 732 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NTSR2O95665 410 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 EZRP15311 586 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 TADA3O75528 432 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 VPS41P49754 854 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 KRT26Q7Z3Y9 468 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 IFT74Q96LB3 600 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 A0A1B0GTH6 734 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 E9PMD0 336 aa20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 KLRK1P26718 216 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 RAD9BQ6WBX8 426 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ZNF365Q70YC5 407 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CABS1Q96KC9 395 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SAMD15Q9P1V8 674 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 UNC13DQ70J99 1090 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 USP17L10C9JJH3 530 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ATP2A1O14983 1001 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NEBLO76041 1014 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 TROAPQ12815 778 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 CAPS2Q9BXY5 557 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 EXOC7Q9UPT5 735 aa20.1■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 BMP3P12645 472 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NFIXQ14938 502 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 NYAP1Q6ZVC0 841 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ANO3Q9BYT9 981 aa20.09■□□□□ 0.81
NOMO3-202ENST00000399336 ADAM21Q9UKJ8 722 aa20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms