RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335523.7

VSTM2B-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene VSTM2B, Length 1,488 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM2B-201ENST00000335523 LIG1P18858 919 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 UBXN2AP68543 259 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 WDR78Q5VTH9 848 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 SLFN12Q8IYM2 578 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 DNERQ8NFT8 737 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MMP19Q99542 508 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 RAB34Q9BZG1 259 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A0G2JMZ2 1700 aa22.11■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 A0A1B0GVL5 298 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 B4DLN1 442 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM86B1E9PN63 330 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM86B2P0C5J1 330 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 TXKP42681 527 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 GRIN1Q05586 938 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PGM5Q15124 567 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 AK8Q96MA6 479 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM20AQ96MK3 541 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 IWS1Q96ST2 819 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PDCD2LQ9BRP1 358 aa22.1■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MEIS1O00470 390 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 SETQ01105 290 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 IL17AQ16552 155 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 NIPA1Q7RTP0 329 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MXRA8Q9BRK3 442 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 DACT1Q9NYF0 836 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 STRNO43815 780 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 ALDH1A1P00352 501 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 NR3C2P08235 984 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PFKFB1P16118 471 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 CCND2P30279 289 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 TXLNAP40222 546 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 NDUFA8P51970 172 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PDIA5Q14554 519 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 SPECC1Q5M775 1068 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 VSIG10LQ86VR7 867 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 EFCC1Q9HA90 598 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNMB3Q9NPA1 279 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.09■■□□□ 1.13
VSTM2B-201ENST00000335523 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 KINO60870 393 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 NR1I2O75469 434 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 MAPK4P31152 587 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 TECP42680 631 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 SYKP43405 635 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 CYP2W1Q8TAV3 490 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 HAS1Q92839 578 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 LENG9Q96B70 501 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 PORCNQ9H237 461 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 WBP1LQ9NX94 342 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 HPSEQ9Y251 543 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.08■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 TLR2O60603 784 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 STAM2O75886 525 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 BCRP11274 1271 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 CCDC183Q5T5S1 534 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ABRAQ8N0Z2 381 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 FAM133AQ8N9E0 248 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 IL31RAQ8NI17 732 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 JADE2Q9NQC1 790 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 CPA4Q9UI42 421 aa22.07■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 MSH4O15457 936 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 UBA7P41226 1012 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 CNTN2Q02246 1040 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 NLRX1Q86UT6 975 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ADGRA2Q96PE1 1338 aa22.06■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 MYH7BA7E2Y1 1941 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 CA12O43570 354 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ZNF202O95125 648 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ITGB5P18084 799 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 STXBP2Q15833 593 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 IGSF22Q8N9C0 903 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 EPSTI1Q96J88 318 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 ZIC5Q96T25 663 aa22.05■■□□□ 1.12
VSTM2B-201ENST00000335523 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms