RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 B4DLN1 442 aa27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 FGD1P98174 961 aa27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 GHRHRQ02643 423 aa27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 ARHGEF16Q5VV41 709 aa27.01■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 ZBTB43O43298 467 aa27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 CASTP20810 708 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 TRIM60Q495X7 471 aa27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 DUSP28Q4G0W2 176 aa27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 AP5M1Q9H0R1 490 aa27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 PXMP2Q9NR77 195 aa27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP27■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 MOXD2PA6NHM9 499 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 ASGR1P07306 291 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 POLR2MP0CAP2 368 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 RPS6KB1P23443 525 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 NKX3-2P78367 333 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 APOBRQ0VD83 1088 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 SNX17Q15036 470 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 IWS1Q96ST2 819 aa26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 PSMA5P28066 241 aa26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 RTN1Q16799 776 aa26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 FCHSD1Q86WN1 690 aa26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 BRF1Q92994 677 aa26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 STARD7Q9NQZ5 370 aa26.98■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 GOLGA8AA7E2F4 631 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 GOLGA8BA8MQT2 603 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 NR3C2P08235 984 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 SEPT14Q6ZU15 432 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 SAMD3Q8N6K7 520 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 SCFD2Q8WU76 684 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 Q9Y3F1 56 aa26.97■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 CDC27P30260 824 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 STXBP2Q15833 593 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 C1orf53Q5VUE5 145 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 COPS5Q92905 334 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 VTI1AQ96AJ9 217 aa26.96■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa26.95■■□□□ 1.91
STRADB-209ENST00000488196 ARIH2O95376 493 aa26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 TLE2Q04725 743 aa26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PPP2R5BQ15173 497 aa26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 GLT1D1Q96MS3 346 aa26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PDCD2LQ9BRP1 358 aa26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 TXNP10599 105 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 FUT2Q10981 343 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 TTLL4Q14679 1199 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 CXCL17Q6UXB2 119 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 OR6J1Q8NGC5 347 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 IL31RAQ8NI17 732 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PRO3102Q9H379 93 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PGM5Q15124 567 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 CCDC62Q6P9F0 684 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 USP17L6PQ6QN14 398 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 RUFY3Q7L099 469 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 AGXT2Q9BYV1 514 aa26.93■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 ELP1O95163 1332 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 RCAN1P53805 252 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 LY6KQ17RY6 165 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 FBXL16Q8N461 479 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 GDF15Q99988 308 aa26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 V9GY48 417 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 MEIS2O14770 477 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 ZEB2O60315 1214 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 VSIG10LQ86VR7 867 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 CUL5Q93034 780 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PDLIM7Q9NR12 457 aa26.91■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PSTPIP2Q9H939 334 aa26.9■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa26.9■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.9■■□□□ 1.9
STRADB-209ENST00000488196 MYH7BA7E2Y1 1941 aa26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 450.1 ms