RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471023.1

NOP56-211, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2

Gene NOP56, Length 592 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-211ENST00000471023 POM121CA8CG34 1229 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 BMP8BP34820 402 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP14P54578 494 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TROAPQ12815 778 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 LBX2Q6XYB7 198 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 GMCL1Q96IK5 515 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 NEK1Q96PY6 1258 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TM6SF1Q9BZW5 370 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 PRO3102Q9H379 93 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TXNRD2Q9NNW7 524 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 FBXO28Q9NVF7 368 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 RBPJLQ9UBG7 517 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 SMCHD1A6NHR9 2005 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa8.73□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 FAM187AA6NFU0 413 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 A6NJR5 290 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L15C9J2P7 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L13C9JLJ4 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L11C9JVI0 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L18D6R9N7 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L22D6RA61 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L17D6RBQ6 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L19D6RCP7 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L20D6RJB6 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 WDR46O15213 610 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 PRC1O43663 620 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 PDHBP11177 359 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 GRM5P41594 1212 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 RBM25P49756 843 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 EVCP57679 992 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 HERVK_113P62684 666 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 USP17L24Q0WX57 530 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 FAM83BQ5T0W9 1011 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 SLFN13Q68D06 897 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TTBK2Q6IQ55 1244 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 LPAR1Q92633 364 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 TCEANC2Q96MN5 208 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 LRRC2Q9BYS8 371 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 A0A0C4DFX4 3053 aa8.72□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 DOCK3Q8IZD9 2030 aa8.71□□□□□ -1.01
NOP56-211ENST00000471023 MSCO60682 206 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 PLA2G6O60733 806 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 RPS6KB1P23443 525 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MCCP23508 829 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MCM5P33992 734 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 RGS2P41220 211 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 LIFRP42702 1097 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ANAPC15P60006 121 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ZNF543Q08ER8 600 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 PLEKHH3Q7Z736 793 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 FEZ1Q99689 392 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 TOMM22Q9NS69 142 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 BTBD7Q9P203 1132 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 STX8Q9UNK0 236 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ZNF536O15090 1300 aa8.71□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 SZT2Q5T011 3432 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 STRNO43815 780 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ADH1CP00326 375 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 NR3C2P08235 984 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 CYP2B6P20813 491 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 FSHRP23945 695 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ERVK-9P63128 1117 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ERVK-24P63145 666 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ATP2B2Q01814 1243 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 KRT32Q14532 448 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 GRM4Q14833 912 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 CCDC178Q5BJE1 867 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 RNF20Q5VTR2 975 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MFSD14CQ5VZR4 134 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 IQCA1Q86XH1 822 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 STAG2Q8N3U4 1231 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 DCAF4Q8WV16 495 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 HPS1Q92902 700 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 ATG4CQ96DT6 458 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 MTMR8Q96EF0 704 aa8.7□□□□□ -1.02
NOP56-211ENST00000471023 TMEM87BQ96K49 555 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms