RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446285.5

ODC1-204, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

TSL 5

Gene ODC1, Length 665 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-204ENST00000446285 STXBP2Q15833 593 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TAAR1Q96RJ0 339 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 MAP3K14Q99558 947 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa31■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TXNP10599 105 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 HSD17B4P51659 736 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 ARHGEF16Q5VV41 709 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TMEM199Q8N511 208 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 COL20A1Q9P218 1284 aa30.99■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 GRIN2DO15399 1336 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 CFBP00751 764 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 ANTXR2P58335 489 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PURAQ00577 322 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 CASC1Q6TDU7 716 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 CHST3Q7LGC8 479 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 MTMR10Q9NXD2 777 aa30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 A6NJR5 290 aa30.97■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 EPHB4P54760 987 aa30.97■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 Q7L0L9 218 aa30.97■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 SENP2Q9HC62 589 aa30.97■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa30.97■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
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ODC1-204ENST00000446285 MCM5P33992 734 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 CCDC62Q6P9F0 684 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 HOMER1Q86YM7 354 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TMTC2Q8N394 836 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 TMEM87BQ96K49 555 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PXMP2Q9NR77 195 aa30.96■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa30.95■■■□□ 2.55
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ODC1-204ENST00000446285 MYL3P08590 195 aa30.95■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 ZNF697Q5TEC3 545 aa30.95■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 PIGSQ96S52 555 aa30.95■■■□□ 2.55
ODC1-204ENST00000446285 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 KIF5BP33176 963 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 PSMC6P62333 389 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 HIPK3Q9H422 1215 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 LY9Q9HBG7 655 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 ANO2Q9NQ90 1003 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa30.94■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 SLC27A2O14975 620 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 PRC1O43663 620 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CYTH3O43739 400 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 ARIH2O95376 493 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 NR3C2P08235 984 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 SMARCA1P28370 1054 aa30.93■■■□□ 2.54
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ODC1-204ENST00000446285 SLC35G1Q2M3R5 365 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP30.93■■■□□ 2.54
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ODC1-204ENST00000446285 ZNF654Q8IZM8 581 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 COPS5Q92905 334 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 LZTS2Q9BRK4 669 aa30.93■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 B4GALT4O60513 344 aa30.92■■■□□ 2.54
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ODC1-204ENST00000446285 RNF20Q5VTR2 975 aa30.92■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CREB3L3Q68CJ9 461 aa30.92■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 COL6A3P12111 3177 aa30.91■■■□□ 2.54
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ODC1-204ENST00000446285 POLR2MP0CAP2 368 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CSF2RAP15509 400 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 GNAQP50148 359 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP30.91■■■□□ 2.54
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ODC1-204ENST00000446285 PDCD2LQ9BRP1 358 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 SPZ1Q9BXG8 430 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 TRPV6Q9H1D0 765 aa30.91■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 LIFRP42702 1097 aa30.9■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 KCNV1Q6PIU1 500 aa30.9■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.549e-7■□□□□ 10.7
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ODC1-204ENST00000446285 CCDC69A6NI79 296 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CALM1P0DP23 149 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CALM2P0DP24 149 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CALM3P0DP25 149 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 CYP2C18P33260 490 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 NFXL1Q6ZNB6 911 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 IL23AQ9NPF7 189 aa30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.54
ODC1-204ENST00000446285 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
ODC1-204ENST00000446285 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
ODC1-204ENST00000446285 ARHGAP1Q07960 439 aa30.88■■■□□ 2.53
ODC1-204ENST00000446285 LY6KQ17RY6 165 aa30.88■■■□□ 2.53
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