RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000364874.1

RNU6-34P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 34, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-34P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-34P-201ENST00000364874 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 HDAC8Q9BY41 377 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CBX8Q9HC52 389 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GDPD2Q9HCC8 539 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TMEM39AQ9NV64 488 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 INSL6Q9Y581 213 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.45□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 A0A1W2PQJ5 194 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TP73O15350 636 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ATP9BO43861 1147 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TBC1D4O60343 1298 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 MATN4O95460 622 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NME2P22392 152 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CCT4P50991 539 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ELLP55199 621 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PPP2R3AQ06190 1150 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ADAM9Q13443 819 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 KIAA0319Q5VV43 1072 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 RHOUQ7L0Q8 258 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ABTB2Q8N961 1025 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TTC16Q8NEE8 873 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 HAS1Q92839 578 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 OR14A2Q96R54 314 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 UCN2Q96RP3 112 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 EHD4Q9H223 541 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ANTXR1Q9H6X2 564 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PRM3Q9NNZ6 103 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PROCRQ9UNN8 238 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 MMP24Q9Y5R2 645 aa0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP0.44□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 KRTAP23-1A1A580 65 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 INSIG1O15503 277 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TRIM37O94972 964 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 SNHG28P0DPA3 235 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GLI4P10075 376 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PCSK2P16519 638 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GRK4P32298 578 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PTGS2P35354 604 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NHLH1Q02575 133 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 DUSP8Q13202 625 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NBPF6Q5VWK0 638 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 AWAT2Q6E213 333 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CD300LDQ6UXZ3 194 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ANKMY2Q8IV38 441 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 DAGLBQ8NCG7 672 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 RNF141Q8WVD5 230 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NR4A3Q92570 626 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PLPPR2Q96GM1 343 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PRIMPOLQ96LW4 560 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NBPF4Q96M43 638 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZSWIM3Q96MP5 696 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 MKNK1Q9BUB5 465 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 KDM4CQ9H3R0 1056 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PCDH18Q9HCL0 1135 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PDLIM7Q9NR12 457 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TJP2Q9UDY2 1190 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CRCT1Q9UGL9 99 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GIT1Q9Y2X7 761 aa0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 B3GALT2O43825 422 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 TYRP1P17643 537 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 NR4A1P22736 598 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 HOXC13P31276 330 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PTGER1P34995 402 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CDK8P49336 464 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 KRTAP12-2P59991 146 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 FOXL1Q12952 345 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 RASIP1Q5U651 963 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 C11orf87Q6NUJ2 197 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 GPR155Q7Z3F1 870 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF276Q8N554 614 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 SIMC1Q8NDZ2 872 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 PROKR1Q8TCW9 393 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 ZNF384Q8TF68 577 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 DPYSL5Q9BPU6 564 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 CDADC1Q9BWV3 514 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 FTSJ1Q9UET6 329 aa0.42□□□□□ -2.34
RNU6-34P-201ENST00000364874 USP17L15C9J2P7 530 aa0.41□□□□□ -2.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.1 ms