RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330334.7

HDDC3-201, Transcript of HD domain containing 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HDDC3, Length 1,047 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3-201ENST00000330334 WTAPQ15007 396 aa20.64■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 STOX1Q6ZVD7 989 aa20.64■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM199Q8N511 208 aa20.64■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 RMDN3Q96TC7 470 aa20.64■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 COL20A1Q9P218 1284 aa20.64■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 ANTXR2P58335 489 aa20.61■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 CHST3Q7LGC8 479 aa20.6■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.59■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 IL23AQ9NPF7 189 aa20.59■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 DDAH1O94760 285 aa20.58■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 CYP2C18P33260 490 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 MCM5P33992 734 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 SEPT14Q6ZU15 432 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 TMEM87BQ96K49 555 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 GUCD1Q96NT3 240 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 LZTS2Q9BRK4 669 aa20.58■□□□□ 0.89
HDDC3-201ENST00000330334 LY9Q9HBG7 655 aa20.58■□□□□ 0.89
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HDDC3-201ENST00000330334 SLC27A2O14975 620 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 KIF5BP33176 963 aa20.57■□□□□ 0.88
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HDDC3-201ENST00000330334 CASC1Q6TDU7 716 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 HOMER1Q86YM7 354 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PDCD2LQ9BRP1 358 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.57■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 PRC1O43663 620 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 POLR2MP0CAP2 368 aa20.56■□□□□ 0.88
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HDDC3-201ENST00000330334 LY6KQ17RY6 165 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF365Q70YC5 407 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 ZNF654Q8IZM8 581 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 AFG1LQ8WV93 481 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 HERVK_113Q902F9 699 aa20.56■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 TGFB3P10600 412 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 GNAQP50148 359 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 LAMC2Q13753 1193 aa20.55■□□□□ 0.88
HDDC3-201ENST00000330334 CREB3L3Q68CJ9 461 aa20.55■□□□□ 0.88
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