RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543175.4

PTRH1-208, Transcript of peptidyl-tRNA hydrolase 1 homolog, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTRH1, Length 814 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTRH1-208	ENST00000543175	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		27.73	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	FPGS	Q05932	587 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	TMEM63B	Q5T3F8	832 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		27.72	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	CABYR	O75952	493 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	EPHB4	P54760	987 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	USH1G	Q495M9	461 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		27.71	■■■□□ 2.03
PTRH1-208	ENST00000543175	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ZEB2	O60315	1214 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	TIMP1	P01033	207 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		27.7	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	PARP1	P09874	1014 aa	Known RBP	27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	CHML	P26374	656 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ADGRF4	Q8IZF3	695 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	DNER	Q8NFT8	737 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		27.69	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ABCB11	O95342	1321 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	EDNRB	P24530	442 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	PDE4D	Q08499	809 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	RGS22	Q8NE09	1264 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		27.68	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	CD4	P01730	458 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	27.67	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	MFSD5	Q6N075	450 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	MAF1	Q9H063	256 aa		27.67	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ITGA7	Q13683	1181 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SEC23A	Q15436	765 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		27.66	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175		B4DLN1	442 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	PTH1R	Q03431	593 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	TRDN	Q13061	729 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	GRIN2D	O15399	1336 aa		27.65	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	CYP21A2	P08686	494 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		27.64	■■■□□ 2.02
PTRH1-208	ENST00000543175	SCN10A	Q9Y5Y9	1956 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PSMC6	P62333	389 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PPP2R5B	Q15173	497 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	FBXO11	Q86XK2	927 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	SCFD2	Q8WU76	684 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	FAM161B	Q96MY7	647 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	GUCD1	Q96NT3	240 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	VAT1L	Q9HCJ6	419 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		27.63	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	SGSM2	O43147	1006 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CPT1A	P50416	773 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TMEM199	Q8N511	208 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TBC1D5	Q92609	795 aa		27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	BUD13	Q9BRD0	619 aa	Known RBP eCLIP	27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	27.62	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	27.61	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	COL20A1	Q9P218	1284 aa		27.61	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	KLRF2	D3W0D1	207 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CSF2RA	P15509	400 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	27.6	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		27.6	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	B4GALT4	O60513	344 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CYP2C18	P33260	490 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	AMN	Q9BXJ7	453 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	HIPK3	Q9H422	1215 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		27.59	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175		E7EWF7	191 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	MYL3	P08590	195 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TXN	P10599	105 aa	Known RBP	27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	TTLL4	Q14679	1199 aa		27.58	■■■□□ 2.01
PTRH1-208	ENST00000543175	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	27.58	■■■□□ 2.01

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