RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489475.5

HOXB3-210, Transcript of homeobox B3, humanhuman

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Gene HOXB3, Length 1,845 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-210ENST00000489475 COG2Q14746 738 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 CKAP2LQ8IYA6 745 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 CPXCR1Q8N123 301 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 TIGD1Q96MW7 591 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 VWA5AO00534 786 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 CFBP00751 764 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 OR52Z1P0C646 297 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 POLR2MP0CAP2 368 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 PPP4R3AQ6IN85 833 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 ATG4CQ96DT6 458 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 TSPY26PQ9H489 355 aa30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP30.43■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 SMCHD1A6NHR9 2005 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 TRAF5O00463 557 aa30.42■■■□□ 2.46
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HOXB3-210ENST00000489475 IL17AQ16552 155 aa30.42■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 TDP2O95551 362 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 DSG3P32926 999 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.41■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 IRF6O14896 467 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 EDIL3O43854 480 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP30.4■■■□□ 2.46
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HOXB3-210ENST00000489475 LDLRAD1Q5T700 205 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 USP49Q70CQ1 688 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 EPSTI1Q96J88 318 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 HOXC10Q9NYD6 342 aa30.4■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 ARHGAP4P98171 946 aa30.39■■■□□ 2.46
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HOXB3-210ENST00000489475 CALCRLQ16602 461 aa30.39■■■□□ 2.46
HOXB3-210ENST00000489475 POTEDQ86YR6 584 aa30.39■■■□□ 2.46
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HOXB3-210ENST00000489475 PARP14Q460N5 1801 aa30.39■■■□□ 2.46
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HOXB3-210ENST00000489475 MYPNQ86TC9 1320 aa30.39■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 CCDC192P0DO97 292 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 ALAS1P13196 640 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 SREBF1P36956 1147 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 FCHSD1Q86WN1 690 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 TBC1D5Q92609 795 aa30.38■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 MCF2L2Q86YR7 1114 aa30.38■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP30.38■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 SLC37A4O43826 429 aa30.37■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 SASS6Q6UVJ0 657 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 MOXD1Q6UVY6 613 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 KRBA2Q6ZNG9 492 aa30.36■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 FUCA2Q9BTY2 467 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 PANK2Q9BZ23 570 aa30.36■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 EHMT1Q9H9B1 1298 aa30.36■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 TXLNAP40222 546 aa30.36■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 CYP3A7P24462 503 aa30.35■■■□□ 2.45
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HOXB3-210ENST00000489475 TXKP42681 527 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 TYRO3Q06418 890 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 TMEM266Q2M3C6 531 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 SAMD3Q8N6K7 520 aa30.33■■■□□ 2.45
HOXB3-210ENST00000489475 TRERF1Q96PN7 1200 aa30.33■■■□□ 2.45
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