RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476612.1

UBE2Q1-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, human

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 301 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PIGS	Q96S52	555 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BCAS3	Q9H6U6	928 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZHX1	Q9UKY1	873 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BRPF3	Q9ULD4	1205 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TELO2	Q9Y4R8	837 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CTDP1	Q9Y5B0	961 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NR2E3	Q9Y5X4	410 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SYNRG	Q9UMZ2	1314 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.65	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYH4	Q9Y623	1939 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ASB14	A6NK59	587 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZBTB5	O15062	677 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PRC1	O43663	620 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ASGR1	P07306	291 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AKR1A1	P14550	325 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RXRA	P19793	462 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CALML3	P27482	149 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BMP8B	P34820	402 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LIFR	P42702	1097 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSD17B4	P51659	736 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ACLY	P53396	1101 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	EPHB4	P54760	987 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GHRHR	Q02643	423 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TNFAIP2	Q03169	654 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FAAP100	Q0VG06	881 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRDN	Q13061	729 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WTAP	Q15007	396 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TRIM60	Q495X7	471 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	FBXO11	Q86XK2	927 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	IL31RA	Q8NI17	732 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PPP1R13L	Q8WUF5	828 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GPKOW	Q92917	476 aa	Predicted RBP eCLIP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LRCH3	Q96II8	777 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TSEN34	Q9BSV6	310 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MYH8	P13535	1937 aa		4.64	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	KBTBD13	C9JR72	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MEIS2	O14770	477 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CDC45	O75419	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CFB	P00751	764 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CD4	P01730	458 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C6orf222	P0C671	652 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CDC27	P30260	824 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MCM5	P33992	734 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HSPA4	P34932	840 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PSMC6	P62333	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SP2	Q02086	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	LY6K	Q17RY6	165 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TYW1B	Q6NUM6	668 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	C16orf59	Q7L2K0	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	RNF180	Q86T96	592 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	VSIG10L	Q86VR7	867 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CCDC82	Q8N4S0	544 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	DNER	Q8NFT8	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	NUP133	Q8WUM0	1156 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	BAD	Q92934	168 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	TMEM87B	Q96K49	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MAP3K14	Q99558	947 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	MTA3	Q9BTC8	594 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	USP26	Q9BXU7	913 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	VTA1	Q9NP79	307 aa		4.63	□□□□□ -1.67
UBE2Q1-204	ENST00000476612	PXMP2	Q9NR77	195 aa		4.63	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms