RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476218.1

RHBDD2-209, Transcript of rhomboid domain containing 2, humanhuman

TSL 5

Gene RHBDD2, Length 181 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2-209ENST00000476218 RAG1P15918 1043 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SMPD1P17405 629 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MAP4K1Q92918 833 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 BADQ92934 168 aa14.7□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TLR3O15455 904 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TIMP1P01033 207 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CYP21A2P08686 494 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 GHRHRQ02643 423 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SART3Q15020 963 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 NCOA7Q8NI08 942 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MTMR8Q96EF0 704 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 IWS1Q96ST2 819 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TBX21Q9UL17 535 aa14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 ERICH2A1L162 156 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 KPNA6O60684 536 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CD4P01730 458 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CALML3P27482 149 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CPT1AP50416 773 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PTH1RQ03431 593 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PDE4DQ08499 809 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SLC30A10Q6XR72 485 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 FBXO11Q86XK2 927 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 FAM126BQ8IXS8 530 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SCFD2Q8WU76 684 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 VTI1AQ96AJ9 217 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 WDR11Q9BZH6 1224 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 JMJD4Q9H9V9 463 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PDGFCQ9NRA1 345 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 LTBP2Q14767 1821 aa14.68□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 KLRF2D3W0D1 207 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 ITGB8P26012 769 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 FPGSQ05932 587 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SHHQ15465 462 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 QRICH1Q2TAL8 776 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MFSD5Q6N075 450 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CYB5R4Q7L1T6 521 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 EEPD1Q7L9B9 569 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 DEFB123Q8N688 67 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MAP3K14Q99558 947 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 AMNQ9BXJ7 453 aa14.67□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 E7EWF7 191 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 BEX3Q00994 111 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 ITGA7Q13683 1181 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 USH1GQ495M9 461 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MTMR10Q9NXD2 777 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.66□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TMEM265A0A087WTH1 108 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 A6NJR5 290 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 ZBTB5O15062 677 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SMARCA1P28370 1054 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TROAPQ12815 778 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TTLL4Q14679 1199 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 WTAPQ15007 396 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 PPP2R5BQ15173 497 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TMTC2Q8N394 836 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 TMEM199Q8N511 208 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 MCM3APO60318 1980 aa14.65□□□□□ -0.06
RHBDD2-209ENST00000476218 LRRC37A2A6NM11 1700 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 HSD17B4P51659 736 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 GRM4Q14833 912 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 STXBP2Q15833 593 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 BMP2KLQ5H9B9 411 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 C9orf50Q5SZB4 431 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 RMDN3Q96TC7 470 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 CPVLQ9H3G5 476 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 GRIN2DO15399 1336 aa14.64□□□□□ -0.07
RHBDD2-209ENST00000476218 LCTP09848 1927 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms