RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415172.1

VPS13A-AS1-201, VPS13A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene VPS13A-AS1, Length 519 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARMCX2Q7L311 632 aa20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa20.1■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SEC24BO95487 1268 aa20.1■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PPP2R5BQ15173 497 aa20.1■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC82Q8N4S0 544 aa20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDRG1Q9NUG6 133 aa20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OGDHLQ9ULD0 1010 aa20.09■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ASTN1O14525 1302 aa20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CFBP00751 764 aa20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 AKR1A1P14550 325 aa20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LHX8Q68G74 356 aa20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKLE1Q8NAG6 615 aa20.08■□□□□ 0.81
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 B4DLN1 442 aa20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ACVR2BQ13705 512 aa20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNERQ8NFT8 737 aa20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NID2Q14112 1375 aa20.07■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 OPLAHO14841 1288 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CEP290O15078 2479 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RARBP10826 455 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CDC27P30260 824 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EVCP57679 992 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GHRHRQ02643 423 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MORC4Q8TE76 937 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TBC1D5Q92609 795 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IL17RAQ96F46 866 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM184BQ9ULE4 1060 aa20.06■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa20.05■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HSD17B4P51659 736 aa20.05■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANO1Q5XXA6 986 aa20.05■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP20.05■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 POLR2MP0CAP2 368 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ADD1P35611 737 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PDE4DQ08499 809 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FUT2Q10981 343 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KATNBL1Q9H079 304 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 VTA1Q9NP79 307 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COL20A1Q9P218 1284 aa20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EDNRBP24530 442 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ANKRD1Q15327 319 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EEPD1Q7L9B9 569 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 NECAB2Q7Z6G3 386 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RMDN3Q96TC7 470 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 hCG_1984214I3L0E3 225 aa20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ARRDC4Q8NCT1 418 aa20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CUL5Q93034 780 aa20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 TAAR1Q96RJ0 339 aa20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.8
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DNM1LO00429 736 aa20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 CCT2P78371 535 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 IWS1Q96ST2 819 aa20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 KBTBD13C9JR72 458 aa20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
VPS13A-AS1-201ENST00000415172 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.5 ms