RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505490.2

ALYREF-202, Transcript of Aly/REF export factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ALYREF, Length 1,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALYREF-202ENST00000505490 MORC4Q8TE76 937 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 CYP39A1Q9NYL5 469 aa35.77■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 DNAJB2P25686 324 aa35.76■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP35.76■■■■□ 3.322e-6■□□□□ 10.5
ALYREF-202ENST00000505490 VPS53Q5VIR6 699 aa35.76■■■■□ 3.32
ALYREF-202ENST00000505490 MUM1L1Q5H9M0 696 aa35.75■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 RASGRP2Q7LDG7 609 aa35.75■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 Q9Y3F1 56 aa35.75■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 ALAS1P13196 640 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 FOSL2P15408 326 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 BEX3Q00994 111 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TAPT1Q6NXT6 567 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 BTNL9Q6UXG8 535 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TICAM2Q86XR7 235 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 EVI5LQ96CN4 794 aa35.74■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 CABYRO75952 493 aa35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 CSF2RAP15509 400 aa35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 IKQ13123 557 aaPredicted RBP35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 GRIN2CQ14957 1233 aa35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 VTI1AQ96AJ9 217 aa35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 HELLSQ9NRZ9 838 aa35.73■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TTC28Q96AY4 2481 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 SMPD1P17405 629 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 IQSEC1Q6DN90 963 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC174Q6PII3 467 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TLK2Q86UE8 772 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM199Q8N511 208 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 DCAF4Q8WV16 495 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 GRIN2DO15399 1336 aa35.72■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TLR3O15455 904 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 ICAM1P05362 532 aa35.71■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP35.71■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 SNAP25P60880 206 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 CHD9Q3L8U1 2897 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 CXCL17Q6UXB2 119 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF576Q9H609 170 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 PDGFCQ9NRA1 345 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP35.7■■■■□ 3.31
ALYREF-202ENST00000505490 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP35.69■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 CHMP4CQ96CF2 233 aa35.69■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 TIFAQ96CG3 184 aa35.69■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 ZMYM6O95789 1325 aa35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 VTA1Q9NP79 307 aa35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 CCPG1Q9ULG6 757 aa35.68■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 MYO9BQ13459 2157 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 FGAP02671 866 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PTGS1P23219 599 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PDE1AP54750 535 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 ZNF365Q70YC5 407 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PBX4Q9BYU1 374 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa35.67■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 ITGA7Q13683 1181 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM63BQ5T3F8 832 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 ANKRD45Q5TZF3 282 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 TTBK2Q6IQ55 1244 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 HERVK_113Q902F9 699 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 AP5M1Q9H0R1 490 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 IL23AQ9NPF7 189 aa35.66■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 TOP1P11387 765 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 TMEM47Q9BQJ4 181 aa35.65■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 ACRP10323 421 aa35.64■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 CYP2C18P33260 490 aa35.64■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 RRP1P56182 461 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
ALYREF-202ENST00000505490 MUC3AQ02505 3323 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 A0A0D9SFI3 127 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 ZEB2O60315 1214 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 PBX2P40425 430 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 SYDE2Q5VT97 1194 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 NSMFQ6X4W1 530 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 FAM227BQ96M60 508 aa35.63■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 GRXCR1A8MXD5 290 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 SLC16A2P36021 539 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 CCDC96Q2M329 555 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 DUSP28Q4G0W2 176 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 EEPD1Q7L9B9 569 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 HIPK3Q9H422 1215 aa35.62■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 UMODL1Q5DID0 1318 aa35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 USP38Q8NB14 1042 aa35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 VWCEQ96DN2 955 aa35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 NFIBO00712 420 aa35.6■■■■□ 3.29
ALYREF-202ENST00000505490 B4GALT4O60513 344 aa35.6■■■■□ 3.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms