RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 PSMB7Q99436 277 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 PHF20Q9BVI0 1012 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 SCP2P22307 547 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 ZNF174Q15697 407 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 NPY5RQ15761 445 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 CNPY4Q8N129 248 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 SCN7AQ01118 1682 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 CDKAL1Q5VV42 579 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 HDAC7Q8WUI4 952 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 ARL8AQ96BM9 186 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 PSMD14O00487 310 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 KRT86O43790 486 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 NF2P35240 595 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 CATIPQ7Z7H3 387 aa15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 GOLGA8KD6RF30 607 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 HSF2BPO75031 334 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 CDR1P51861 262 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 CUL4BQ13620 913 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 OR8K1Q8NGG5 319 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 GRIN2DO15399 1336 aa15.02■□□□□ -0
NISCH-212ENST00000488380 TRIM75PA6NK02 468 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 KRT2P35908 639 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 IQCEQ6IPM2 695 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CLEC4GQ6UXB4 293 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 N4BP2L2Q92802 583 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PAGE5Q96GU1 130 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 BRIP1Q9BX63 1249 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 EP400Q96L91 3159 aa15.02□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 TTC26A0AVF1 554 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 FBXO33Q7Z6M2 555 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 RPAINQ86UA6 219 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 NEDD9Q14511 834 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 IQCA1Q86XH1 822 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 LRRC1Q9BTT6 524 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ18B7U540 433 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 RPS8P62241 208 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 KCNJ12Q14500 433 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 MTA3Q9BTC8 594 aa15.01□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CHUKO15111 745 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 KRT14P02533 472 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CYP27A1Q02318 531 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 DPYDQ12882 1025 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 IFT88Q13099 833 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 MICALCLQ6ZW33 695 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 TMTC3Q6ZXV5 915 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 EEF2KMTQ96G04 330 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 USP17L8P0C7I0 530 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 RCAN1P53805 252 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 KRT83P78385 493 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 GUCY1A3Q02108 690 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 TNFRSF25Q93038 417 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 LACRTQ9GZZ8 138 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PPP2R5AQ15172 486 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 AMOTL1Q8IY63 956 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 SPATA20Q8TB22 786 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 CXCR5P32302 372 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 NNTQ13423 1086 aa14.99□□□□□ -0.01
NISCH-212ENST00000488380 TRIM14Q14142 442 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.4 ms