RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SMCHD1A6NHR9 2005 aa22.21■■□□□ 1.15
NISCH-209ENST00000485765 NFIBO00712 420 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 COL6A1P12109 1028 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 RASEFQ8IZ41 740 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 RGS22Q8NE09 1264 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.2■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 LIFRP42702 1097 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 NSMFQ6X4W1 530 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 RIOX1Q9H6W3 641 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ASTN1O14525 1302 aa22.19■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 QRICH1Q2TAL8 776 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ARMCX2Q7L311 632 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 NEK1Q96PY6 1258 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 KATNBL1Q9H079 304 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 VAT1LQ9HCJ6 419 aa22.18■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ASB14A6NK59 587 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ACVR2BQ13705 512 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 MORC4Q8TE76 937 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 C11orf49Q9H6J7 331 aa22.17■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ABCB11O95342 1321 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 DDAH1O94760 285 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 AKR1A1P14550 325 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 HSPA4P34932 840 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 KRT32Q14532 448 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ADCK5Q3MIX3 580 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ANO1Q5XXA6 986 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 FBXO11Q86XK2 927 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ZNF654Q8IZM8 581 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ARRDC4Q8NCT1 418 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 FAM184BQ9ULE4 1060 aa22.16■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 DNM1LO00429 736 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 ZBTB5O15062 677 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 CYTH3O43739 400 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 REC8O95072 547 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
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NISCH-209ENST00000485765 RNF207Q6ZRF8 634 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 SGMS1Q86VZ5 419 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 DPF3Q92784 378 aa22.15■■□□□ 1.14
NISCH-209ENST00000485765 PTPDC1A2A3K4 754 aa22.14■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 RARBP10826 455 aa22.14■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 SMARCA1P28370 1054 aa22.14■■□□□ 1.13
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NISCH-209ENST00000485765 AMNQ9BXJ7 453 aa22.14■■□□□ 1.13
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NISCH-209ENST00000485765 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CCDC69A6NI79 296 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 LRRC41Q15345 812 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 NFXL1Q6ZNB6 911 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 NUP133Q8WUM0 1156 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 TBC1D5Q92609 795 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 LRRC2Q9BYS8 371 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.13■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CALM1P0DP23 149 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CALM2P0DP24 149 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CALM3P0DP25 149 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CALML3P27482 149 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 KIF5BP33176 963 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 GHRHRQ02643 423 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CCDC144BQ3MJ40 725 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 DNERQ8NFT8 737 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 PIGSQ96S52 555 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 MYL10Q9BUA6 226 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.12■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 OPLAHO14841 1288 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 LZTS2Q9BRK4 669 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 USP26Q9BXU7 913 aa22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 LCTP09848 1927 aa22.1■■□□□ 1.13
NISCH-209ENST00000485765 ADCY6O43306 1168 aa22.1■■□□□ 1.13
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