RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465909.2

SOGA3-201, Transcript of SOGA family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SOGA3, Length 3,756 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3-201ENST00000465909 MARCH6O60337 910 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KRT13P13646 458 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GBP1P32455 592 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 LLGL1Q15334 1064 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KIAA0825Q8IV33 1275 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ECT2Q9H8V3 914 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PNMA2Q9UL42 364 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TMEM154Q6P9G4 183 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PI16Q6UXB8 463 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 OXER1Q8TDS5 423 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 VCXQ9H320 206 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SENP2Q9HC62 589 aa16.39■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CCT8L1PA6NM43 557 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GPAA1O43292 621 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CUL4BQ13620 913 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CHMP6Q96FZ7 201 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZFATQ9P243 1243 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 FBXL5Q9UKA1 691 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GUCY1A2P33402 732 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SKOR1P84550 965 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DRP2Q13474 957 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TCERG1LQ5VWI1 586 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CEP128Q6ZU80 1094 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GOLPH3Q9H4A6 298 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ABCA6Q8N139 1617 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TRPM2O94759 1503 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 NLRP5P59047 1200 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KCNJ2P63252 427 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ASIC1P78348 528 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CUL3Q13618 768 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 WLSQ5T9L3 541 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ERICH1Q86X53 443 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MB21D1Q8N884 522 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 INTUQ9ULD6 942 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 HPSEQ9Y251 543 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MED23Q9ULK4 1368 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF609O15014 1411 aa16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP16.38■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 A8MUI8 341 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZNF449Q6P9G9 518 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TTC5Q8N0Z6 440 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GDAP1Q8TB36 358 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 FAM69CQ0P6D2 419 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RAPGEF1Q13905 1077 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PLCB4Q15147 1175 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 APOA5Q6Q788 366 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 FAM228AQ86W67 206 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 HAUS7Q99871 368 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 EXOC1Q9NV70 894 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 USPL1Q5W0Q7 1092 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 CCDC155Q8N6L0 562 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 FAM114A2Q9NRY5 505 aa16.37■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PTPREP23469 700 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SCNN1BP51168 640 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PTPAQ15257 358 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 NUGGCQ68CJ6 796 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KIF11P52732 1056 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 WTAPQ15007 396 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa16.36■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 STXBP3O00186 592 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 GRIK3Q13003 919 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ETNK1Q9HBU6 452 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RMND1Q9NWS8 449 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 KRIT1O00522 736 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PPFIA2O75334 1257 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PRCPP42785 496 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 RPS6KA1Q15418 735 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa16.35■□□□□ 0.21
SOGA3-201ENST00000465909 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms