RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DCDC2CA8MYV0 355 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA0355O15063 1070 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf50Q5SZB4 431 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D10CQ8IV04 446 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TOX2Q96NM4 488 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPCPD1Q9NPB8 672 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM39AQ9NV64 488 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 COL6A3P12111 3177 aa30.84■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ELP1O95163 1332 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASGR1P07306 291 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAG1P15918 1043 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TNFAIP2Q03169 654 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNASQ5JWF2 1037 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NSMFQ6X4W1 530 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TTC14Q96N46 770 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa30.83■■■□□ 2.53
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITGB8P26012 769 aa30.82■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAAP100Q0VG06 881 aa30.82■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ASTN1O14525 1302 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF213O14771 459 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDHBP11177 359 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ESR2Q92731 530 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VTI1AQ96AJ9 217 aa30.81■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa30.8■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH7Q68CQ1 1323 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIP1O00291 1037 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKX3-2P78367 333 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC17A8Q8NDX2 589 aa30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NEDD4P46934 1319 aa30.78■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTAGE5O15320 804 aa30.78■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF543Q08ER8 600 aa30.78■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC37A2A6NM11 1700 aa30.78■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDK7P50613 346 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BEX3Q00994 111 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FPGSQ05932 587 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PNMA2Q9UL42 364 aa30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LAMA4Q16363 1823 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NFIBO00712 420 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNHG28P0DPA3 235 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NT5C2P49902 561 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQSEC1Q6DN90 963 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EEPD1Q7L9B9 569 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLK2Q86UE8 772 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AP5M1Q9H0R1 490 aa30.76■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCTP09848 1927 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARVCFO00192 962 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EPHB4P54760 987 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAPT1Q6NXT6 567 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MORC4Q8TE76 937 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VTA1Q9NP79 307 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PDGFCQ9NRA1 345 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBX21Q9UL17 535 aa30.75■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPDC1A2A3K4 754 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIMP1P01033 207 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMPD1P17405 629 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC178Q5BJE1 867 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF697Q5TEC3 545 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DGKHQ86XP1 1220 aa30.74■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM4AO75164 1064 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCA1Q86XH1 822 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM161BQ96MY7 647 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSCC1Q9BVC3 393 aa30.73■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CXCL17Q6UXB2 119 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC4DQ8WXI8 215 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 Q9Y3F1 56 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WDR19Q8NEZ3 1342 aa30.72■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLR3O15455 904 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZEB2O60315 1214 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CABYRO75952 493 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC30A10Q6XR72 485 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RNF207Q6ZRF8 634 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GUCD1Q96NT3 240 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CTNNA3Q9UI47 895 aa30.71■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GOLGA8HP0CJ92 632 aa30.7■■■□□ 2.51
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTGS1P23219 599 aa30.7■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 113.8 ms