RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229270.8

TPI1-201, Transcript of triosephosphate isomerase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TPI1, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1-201ENST00000229270 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 POTEB2H3BUK9 544 aa29.56■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 GRIPAP1Q4V328 841 aa29.56■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 RAD9BQ6WBX8 426 aa29.56■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 TEKT1Q969V4 418 aa29.56■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 ECE2O60344 883 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 STX17P56962 302 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 DACT2Q5SW24 774 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 BLIDQ8IZY5 108 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CEP112Q8N8E3 955 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 NEDD1Q8NHV4 660 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 UBXN6Q9BZV1 441 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CTNND2Q9UQB3 1225 aa29.55■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 SOWAHDA6NJG2 315 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 H7C1D1 291 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 KRT31Q15323 416 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 RRAGBQ5VZM2 374 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PCDHA4Q9UN74 947 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 USP17L3A6NCW0 530 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 USP17L4A6NCW7 530 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PLA2G4AP47712 749 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 KCNB1Q14721 858 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 SOGA3Q5TF21 947 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 USP17L1Q7RTZ2 530 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PNMA1Q8ND90 353 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 USP40Q9NVE5 1235 aa29.54■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 LAD1O00515 517 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 GYPCP04921 128 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 NOVP48745 357 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 COPB1P53618 953 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 GABPAQ06546 454 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 GRM4Q14833 912 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 BRD3Q15059 726 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 ZDHHC15Q96MV8 337 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 DESI2Q9BSY9 194 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 KCNQ5Q9NR82 932 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CDC23Q9UJX2 597 aa29.53■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PSME4Q14997 1843 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 RPN1P04843 607 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 SCNN1DP51172 638 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 IL17AQ16552 155 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CASP14P31944 242 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CRKP46108 304 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 MTF1Q14872 753 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 GPR162Q16538 588 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 TCP11X2Q5H9J9 407 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 CYP26C1Q6V0L0 522 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 MTRQ99707 1265 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 MAGEF1Q9HAY2 307 aa29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 PLIN4Q96Q06 1357 aa29.51■■■□□ 2.32
TPI1-201ENST00000229270 M0R2N6 131 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 NFKBIEO00221 500 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 N4BP3O15049 544 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 CASP1P29466 404 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 KARSQ15046 597 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 CCDC148Q8NFR7 591 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 NELFBQ8WX92 580 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 LZTS2Q9BRK4 669 aa29.51■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 MCM7P33993 719 aa29.5■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 WWC2Q6AWC2 1192 aa29.5■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP29.5■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 CCSER1Q9C0I3 900 aa29.5■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 CCDC151A5D8V7 595 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 PRPHP41219 470 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 TMEM47Q9BQJ4 181 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 CUEDC2Q9H467 287 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 ARFGAP3Q9NP61 516 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 MYO3BQ8WXR4 1341 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 MYH8P13535 1937 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 A0A1W2PQC6 194 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 KCNJ18B7U540 433 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 TUBBP07437 444 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 KCNJ12Q14500 433 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 AOC3Q16853 763 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 ABHD10Q9NUJ1 306 aa29.49■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 PICALMQ13492 652 aa29.48■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 TEX35Q5T0J7 233 aa29.48■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 PSMD1Q99460 953 aa29.48■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 DISC1Q9NRI5 854 aa29.48■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 ADSSL1Q8N142 457 aa29.47■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 PARD6BQ9BYG5 372 aa29.47■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 SWAP70Q9UH65 585 aa29.47■■■□□ 2.31
TPI1-201ENST00000229270 TBC1D8O95759 1140 aa29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.9 ms