RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510204.5

SH3BP2-217, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 3,617 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-217ENST00000510204 ABCF2Q9UG63 623 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CLIC4Q9Y696 253 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 RASSF10A6NK89 507 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF569Q5MCW4 686 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ABCC6O95255 1503 aa13.07□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 POLE2P56282 527 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PACS1Q6VY07 963 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC148Q8NFR7 591 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 C8orf76Q96K31 380 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 C19orf44Q9H6X5 657 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC5A4Q9NY91 659 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NEDD4P46934 1319 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 RNMTO43148 476 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ALDH3A1P30838 453 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DRP2Q13474 957 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SH3GL2Q99962 352 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ACTR5Q9H9F9 607 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ATXN10Q9UBB4 475 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CARMIL3Q8ND23 1372 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CYP21A2P08686 494 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CHRNA2Q15822 529 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SPRED3Q2MJR0 410 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 LCA5Q86VQ0 697 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ARHGEF25Q86VW2 580 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PALB2Q86YC2 1186 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DIP2AQ14689 1571 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DNM1LO00429 736 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CLTAP09496 248 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PTPN21Q16825 1174 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NAA35Q5VZE5 725 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 MKS1Q9NXB0 559 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 AXIN2Q9Y2T1 843 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DIAPH2O60879 1101 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 AKAP4Q5JQC9 854 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ANO1Q5XXA6 986 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 FAAH2Q6GMR7 532 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 JAKMIP2Q96AA8 810 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 OPTNQ96CV9 577 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DACH1Q9UI36 760 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ASB3Q9Y575 518 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 LRRD1A4D1F6 860 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 AGPSO00116 658 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 TPPPO94811 219 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CNGA1P29973 690 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PDCLQ13371 301 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 STIM1Q13586 685 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PPFIBP1Q86W92 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ERMNQ8TAM6 284 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SUCLG2Q96I99 432 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 MYD88Q99836 296 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SOGA3Q5TF21 947 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 WDR93Q6P2C0 686 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SLC43A3Q8NBI5 491 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DYDC1Q8WWB3 177 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PCDH18Q9HCL0 1135 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SALL1Q9NSC2 1324 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 FXNQ16595 210 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SEPT14Q6ZU15 432 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 CCDC121Q6ZUS5 278 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PANX2Q96RD6 677 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 ADGRG1Q9Y653 693 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PI16Q6UXB8 463 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 PTK7Q13308 1070 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 KCNH5Q8NCM2 988 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 INTS13Q9NVM9 706 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-217ENST00000510204 SWAP70Q9UH65 585 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms