RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 ABCB5Q2M3G0 1257 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 NAALADL2Q58DX5 795 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 PDXDC2PQ6P474 469 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 PLA2G4DQ86XP0 818 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 SPICE1Q8N0Z3 855 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 FAM151AQ8WW52 585 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 UIMC1Q96RL1 719 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 VEZTQ9HBM0 779 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 NYAP2Q9P242 653 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 NRBP1Q9UHY1 535 aa5.53□□□□□ -1.52
ANKRD28-212ENST00000497037 TDP2O95551 362 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CD44P16070 742 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 NT5C2P49902 561 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 NAPAP54920 295 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ICA1Q05084 483 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 DLGAP5Q15398 846 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 QRICH1Q2TAL8 776 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ASPRV1Q53RT3 343 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC178Q5BJE1 867 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 POTEDQ86YR6 584 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 AGBL3Q8NEM8 1001 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF287Q9HBT7 754 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0G2JMZ2 1700 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 LTBP3Q9NS15 1303 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 F5H6K3 240 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 COBLO75128 1261 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SMARCA1P28370 1054 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF165P49910 485 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 MAP3K10Q02779 954 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 KLRC3Q07444 240 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC144BQ3MJ40 725 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SLFN13Q68D06 897 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CIAPIN1Q6FI81 312 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 AOPEPQ8N6M6 819 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SPATA20Q8TB22 786 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TIGD1Q96MW7 591 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 MAN1B1Q9UKM7 699 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CD2APQ9Y5K6 639 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 LRRC37A2A6NM11 1700 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 GNAQP50148 359 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ARID5BQ14865 1188 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 STX1AQ16623 288 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC96Q2M329 555 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 UVSSAQ2YD98 709 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM179Q6ZVK1 233 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 MICALL2Q8IY33 904 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TBCKQ8TEA7 893 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 TBC1D5Q92609 795 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 DHX58Q96C10 678 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT12Q9BQG2 462 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 VPS33BQ9H267 617 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.52□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L15C9J2P7 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L11C9JVI0 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L18D6R9N7 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L22D6RA61 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L19D6RCP7 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L20D6RJB6 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 MEIS2O14770 477 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.537e-8■■■□□ 17
ANKRD28-212ENST00000497037 POLD1P28340 1107 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 NLRP12P59046 1061 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L24Q0WX57 530 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 KARSQ15046 597 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ECM1Q16610 540 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 GRIPAP1Q4V328 841 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 NT5DC1Q5TFE4 455 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 USP17L6PQ6QN14 398 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SASS6Q6UVJ0 657 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC30A10Q6XR72 485 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CRYGNQ8WXF5 182 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 DPF2Q92785 391 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 PAGE5Q96GU1 130 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 CCDC17Q96LX7 622 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 LZTS2Q9BRK4 669 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXO28Q9NVF7 368 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ESYT2A0FGR8 921 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB5O15062 677 aa5.51□□□□□ -1.53
ANKRD28-212ENST00000497037 ATP1A3P13637 1013 aa5.51□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms