RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492539.5

NELFE-212, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 3

Gene NELFE, Length 583 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-212ENST00000492539 TMEM39AQ9NV64 488 aa23.68■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 ERC2O15083 957 aa23.67■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 TSPY3P0CV98 308 aa23.67■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 TSPY8P0CW00 308 aa23.67■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 FDX1P10109 184 aa23.67■■□□□ 1.38
NELFE-212ENST00000492539 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa23.67■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 LRRC37A2A6NM11 1700 aa23.67■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 KATNBL1Q9H079 304 aa23.66■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 ELP1O95163 1332 aa23.65■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 TBX21Q9UL17 535 aa23.65■■□□□ 1.38
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NELFE-212ENST00000492539 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 ACAD9Q9H845 621 aa23.64■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 MROH7Q68CQ1 1323 aa23.63■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 TIMP1P01033 207 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 ASGR1P07306 291 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 NKX3-2P78367 333 aa23.63■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 FAM133AQ8N9E0 248 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 STAG1Q8WVM7 1258 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP23.63■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 LCTP09848 1927 aa23.63■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 MYLIPQ8WY64 445 aa23.62■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 AGBL1Q96MI9 1066 aa23.61■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 RNF146Q9NTX7 359 aa23.61■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 IL17RBQ9NRM6 502 aa23.6■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 SOWAHBA6NEL2 793 aa23.59■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.372e-7■■■□□ 15.7
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NELFE-212ENST00000492539 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 TSPY2A6NKD2 308 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 NOVP48745 357 aa23.58■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa23.58■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 CRBNQ96SW2 442 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 ANAPC4Q9UJX5 808 aa23.58■■□□□ 1.37
NELFE-212ENST00000492539 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
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NELFE-212ENST00000492539 ASB14A6NK59 587 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 FOSL2P15408 326 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 TNFAIP2Q03169 654 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 IKQ13123 557 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 KCTD1Q719H9 257 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 RASGRP2Q7LDG7 609 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 INCENPQ9NQS7 918 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 PRR12Q9ULL5 1215 aa23.57■■□□□ 1.36
NELFE-212ENST00000492539 NMT2O60551 498 aa23.56■■□□□ 1.36
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