RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486028.1

HMG20B-211, Transcript of high mobility group 20B, humanhuman

TSL 2

Gene HMG20B, Length 719 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20B-211ENST00000486028 MTFR1Q15390 333 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 TKFCQ3LXA3 575 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 TSGA10IPQ3SY00 556 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC174Q6PII3 467 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 TMTC2Q8N394 836 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CHST13Q8NET6 341 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 TRIB2Q92519 343 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 RNF208Q9H0X6 261 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 PNMA2Q9UL42 364 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 RIPK3Q9Y572 518 aa14.55□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 COBLO75128 1261 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 RGS19P49795 217 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 ANTXR2P58335 489 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CCL14Q16627 93 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 NPLOC4Q8TAT6 608 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 DDX11Q96FC9 970 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 TMEM87BQ96K49 555 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 NEK1Q96PY6 1258 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 UBA5Q9GZZ9 404 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 UNC93B1Q9H1C4 597 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CENPFP49454 3210 aa14.54□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 ZNF536O15090 1300 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 POTEFA5A3E0 1075 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 ICAM1P05362 532 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 GJB1P08034 283 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 ALAS1P13196 640 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 HSPA4P34932 840 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 KCNB2Q92953 911 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.53□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 RPTORQ8N122 1335 aa14.52□□□□□ -0.08
HMG20B-211ENST00000486028 PGK2P07205 417 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 TRIM32Q13049 653 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 NFXL1Q6ZNB6 911 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 RASEFQ8IZ41 740 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 ANKRD35Q8N283 1001 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 ACAD9Q9H845 621 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 LY9Q9HBG7 655 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 SENP2Q9HC62 589 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 RNF146Q9NTX7 359 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 FLRT1Q9NZU1 646 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 PLXNB2O15031 1838 aa14.52□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 WDR19Q8NEZ3 1342 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CCDC69A6NI79 296 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 KLRF2D3W0D1 207 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CAPN2P17655 700 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 EN2P19622 333 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 LIFRP42702 1097 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 TROAPQ12815 778 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 GRM4Q14833 912 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 ZNF792Q3KQV3 632 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 ADGRF4Q8IZF3 695 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 MAML3Q96JK9 1138 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CYP2C19P33261 490 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 GJA8P48165 433 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DEFB118Q96PH6 123 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 MAP3K14Q99558 947 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 USP26Q9BXU7 913 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CPVLQ9H3G5 476 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 MAD2L2Q9UI95 211 aa14.5□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 PFASO15067 1338 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 POTEB2H3BUK9 544 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 DDAH1O94760 285 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 SGPL1O95470 568 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 IGHA2P01877 340 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 TFRCP02786 760 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CALM1P0DP23 149 aa14.49□□□□□ -0.09
HMG20B-211ENST00000486028 CALM2P0DP24 149 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms