RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 CHMP4BP1P59074 171 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 OLFML2BQ68BL8 750 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CRBNQ96SW2 442 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SIRT5Q9NXA8 310 aa4.77□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TNFRSF10CO14798 259 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZGLP1P0C6A0 271 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 EIF6P56537 245 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP4Q13115 394 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF827Q17R98 1081 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM192Q8IY95 271 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 RNF141Q8WVD5 230 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CPLX3Q8WVH0 158 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 VWCEQ96DN2 955 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GPR160Q9UJ42 338 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa4.76□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 OVOL3O00110 214 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZXDAP98168 799 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 EGR3Q06889 387 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DTWD2Q8NBA8 298 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GPATCH2Q9NW75 528 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP13Q9UII6 198 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 WASH4PA8MWX3 477 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 K7ESM1 405 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GIPRP48546 466 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF6Q5VWK0 638 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ANKS4BQ8N8V4 417 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 PANK1Q8TE04 598 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SHDQ96IW2 340 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF4Q96M43 638 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SLC6A18Q96N87 628 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TM9SF2Q99805 663 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 KCNH3Q9ULD8 1083 aa4.75□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 N4BP3O15049 544 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC3AO75596 197 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GUCY2CP25092 1073 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CCNFP41002 786 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GAB4Q2WGN9 574 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 HHIPL2Q6UWX4 724 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 UNC5AQ6ZN44 842 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 OR6P1Q8NGX9 317 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ANAPC16Q96DE5 110 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ASPNQ9BXN1 380 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF408Q9H9D4 720 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 MRVI1Q9Y6F6 885 aa4.74□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CNKSR3Q6P9H4 555 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DPH6Q7L8W6 267 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 CKAP2LQ8IYA6 745 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 FAM169BQ8N8A8 192 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ADAM7Q9H2U9 754 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LTKP29376 864 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ETFBP38117 255 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 PPP2R5EQ16537 467 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TIGD5Q53EQ6 642 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LINC01356Q8N9X3 169 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LNPKQ9C0E8 428 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 MKRN2Q9H000 416 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 FAM86C1Q9NVL1 165 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 PRKAG3Q9UGI9 489 aa4.73□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 LTBP3Q9NS15 1303 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SHISA3A0PJX4 238 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 C9IYK1 514 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ABLIM1O14639 778 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 RNF4P78317 190 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 NBPF9Q3BBW0 867 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 DHRS1Q96LJ7 313 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 GPR62Q9BZJ7 368 aa4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CCDC82-202ENST00000423339 A0A1W2PQH9 124 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 KLF4O43474 513 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TP53P04637 393 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 SERINC3Q13530 473 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TNNI3KQ59H18 835 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ADGRF1Q5T601 910 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 ANKS3Q6ZW76 656 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 TMC3Q7Z5M5 1100 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PPFIBP1Q86W92 1011 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PCDHB10Q9UN67 800 aa4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 PMS1P54277 932 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CCDC82-202ENST00000423339 RTP5Q14D33 572 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 87.9 ms