RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 COBLO75128 1261 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 TTLL1O95922 423 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 BRMS1Q9HCU9 246 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SERPINA10Q9UK55 444 aa20.32■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 JMYQ8N9B5 988 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SMCO2A6NFE2 343 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 CUTAO60888 179 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PRELPP51888 382 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 BARHL2Q9NY43 387 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PI4KBQ9UBF8 816 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ECE1P42892 770 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 MMP14P50281 582 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 UBE2SQ16763 222 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA4Q9UN74 947 aa20.31■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SPDYE6P0CI01 402 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 IQCB1Q15051 598 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRF4Q8IZF3 695 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 CYP2C19P33261 490 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DLGAP5Q15398 846 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 NFKBIEO00221 500 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 STX1AQ16623 288 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 LETM2Q2VYF4 491 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 TRIM5Q9C035 493 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ST7Q9NRC1 585 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 BMP6P22004 513 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 KMT5BQ4FZB7 885 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 OGFOD1Q8N543 542 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 CENPFP49454 3210 aa20.29■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 A0A1W2PRG0 241 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 TNNT1P13805 278 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 KRBA2Q6ZNG9 492 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 NIM1KQ8IY84 436 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 IDI2Q9BXS1 227 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 GJA3Q9Y6H8 435 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 DGKZQ13574 1117 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 VIL1P09327 827 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ACER1Q8TDN7 264 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 GMLQ99445 158 aa20.28■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF543Q08ER8 600 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 BLZF1Q9H2G9 400 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 RASSF4Q9H2L5 321 aa20.27■□□□□ 0.84
PDE4D-204ENST00000358923 BECN2A8MW95 431 aa20.27■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 GNAQP50148 359 aa20.27■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ICA1Q05084 483 aa20.27■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.27■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.27■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 M0R2N6 131 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 POLD1P28340 1107 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 IKQ13123 557 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 PSMD1Q99460 953 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SWAP70Q9UH65 585 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CTAGE5O15320 804 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SLC1A4P43007 532 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SPZ1Q9BXG8 430 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 FOCADQ5VW36 1801 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SMCHD1A6NHR9 2005 aa20.26■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 ARID5BQ14865 1188 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CCDC178Q5BJE1 867 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 DLK2Q6UY11 383 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 FAM53CQ9NYF3 392 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 MYH8P13535 1937 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CLGNO14967 610 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USH1GQ495M9 461 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 DRC7Q8IY82 874 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SLC16A10Q8TF71 515 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 SIPA1L1O43166 1804 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L15C9J2P7 530 aa20.25■□□□□ 0.83
PDE4D-204ENST00000358923 USP17L13C9JLJ4 530 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms