RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600442.5

ZNF548-210, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 535 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-210ENST00000600442 MMP1P03956 469 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 SNHG28P0DPA3 235 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 NLRP5P59047 1200 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 ZNF543Q08ER8 600 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 FUT2Q10981 343 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 RESTQ13127 1097 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 USP17L2Q6R6M4 530 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 BICD2Q8TD16 824 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 SPATA32Q96LK8 384 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 FEZ1Q99689 392 aa14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 USP17L5A8MUK1 530 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 F5H6K3 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 UBE2Q2LH0YL09 131 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 TRAK2O60296 914 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 GNA11P29992 359 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 KRT2P35908 639 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 KLRC3Q07444 240 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 IKQ13123 557 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 TMEM87AQ8NBN3 555 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 AS3MTQ9HBK9 375 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 TBC1D8O95759 1140 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 UBE2HP62256 183 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 NOSTRINQ8IVI9 506 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 CHURC1Q8WUH1 139 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 TEPSINQ96N21 525 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 TMX2Q9Y320 296 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 ELP1O95163 1332 aa14.66□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 FIBPO43427 364 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 BMP15O95972 392 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 GOLGA8HP0CJ92 632 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 BMP3P12645 472 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 USP14P54578 494 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PPP1R18Q6NYC8 613 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 LPAR1Q92633 364 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 RIOX1Q9H6W3 641 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 VAT1LQ9HCJ6 419 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 C6orf50Q9HD87 102 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 BARHL2Q9NY43 387 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PNMA2Q9UL42 364 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 CNPY2Q9Y2B0 182 aa14.65□□□□□ -0.06
ZNF548-210ENST00000600442 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 DTNBO60941 627 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 GUCY1A2P33402 732 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 TM4SF4P48230 202 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 NAPAP54920 295 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 PKN1Q16512 942 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 MCTP2Q6DN12 878 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 FAM160B2Q86V87 743 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 PIBF1Q8WXW3 757 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 VPS54Q9P1Q0 977 aa14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 PHF20L1A8MW92 1017 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 YEATS4O95619 227 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 NDUFB10O96000 172 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 STK38Q15208 465 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 MYSM1Q5VVJ2 828 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 HOMER1Q86YM7 354 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 SCYL3Q8IZE3 742 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 AIFM3Q96NN9 605 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 WRNIP1Q96S55 665 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 LMBRD1Q9NUN5 540 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 POLR3EQ9NVU0 708 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.63□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 GPR25O00155 361 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 ZBTB5O15062 677 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 TRAPPC10P48553 1259 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 STAT2P52630 851 aa14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
ZNF548-210ENST00000600442 KCTD1Q719H9 257 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms