RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ARPC5LQ9BPX5 153 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 HAUS2Q9NVX0 235 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MGRN1O60291 552 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PFKFB2O60825 505 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP6V1G2O95670 118 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PROSER3Q2NL68 480 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CFAP100Q494V2 611 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SH3GL2Q99962 352 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SDF4Q9BRK5 362 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 VCX3BQ9H321 246 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC52A2Q9HAB3 445 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 VCX3AQ9NNX9 186 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 GRIN2DO15399 1336 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 HSF2BPO75031 334 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 VIL1P09327 827 aaKnown RBP8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 UBASH3AP57075 661 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP5P59047 1200 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC15Q0P6D6 951 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 AKNAD1Q5T1N1 836 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 IQCEQ6IPM2 695 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PDILTQ8N807 584 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MYD88Q99836 296 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 BABAM1Q9NWV8 329 aa8.63□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 GRIN3BO60391 1043 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ANP32DO95626 131 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NAT1P18440 290 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MRPS35P82673 323 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CUL4BQ13620 913 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC155Q8N6L0 562 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM81BQ96LP2 452 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 VCXQ9H320 206 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ZWILCHQ9H900 591 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 BIN1O00499 593 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS6KA4O75676 772 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 STARD3NLO95772 234 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 VIMP08670 466 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 XRCC4Q13426 336 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KARSQ15046 597 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SFMBT2Q5VUG0 894 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NUGGCQ68CJ6 796 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KSR2Q6VAB6 950 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 WHAMMQ8TF30 809 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MAIP1Q8WWC4 291 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 FSD1Q9BTV5 496 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 HYPKQ9NX55 129 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PEAK1Q9H792 1746 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SMAPO00193 183 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 APBA1Q02410 837 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 RIPK1Q13546 671 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KIAA0753Q2KHM9 967 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ARL10Q8N8L6 244 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SSH3Q8TE77 659 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 BOLA2Q9H3K6 86 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.62□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 A6NHS1 94 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 M0R2C6 588 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NPTXRO95502 500 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 SCNN1BP51168 640 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 PDCLQ13371 301 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 BEND3Q5T5X7 828 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ALS2CLQ60I27 953 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ZNF280DQ6N043 979 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 COPS6Q7L5N1 327 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 NLRP14Q86W24 1093 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 FAM228AQ86W67 206 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 CCDC87Q9NVE4 849 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 RTEL1Q9NZ71 1219 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ATXN10Q9UBB4 475 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 TMCO1Q9UM00 188 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 RGPD2P0DJD1 1756 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0G2JLW4 131 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 DTNBO60941 627 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 LINGO3P0C6S8 592 aa8.61□□□□□ -1.03
EFTUD2-218ENST00000590367 USP14P54578 494 aa8.61□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms