RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469376.5

OPN3-204, Transcript of opsin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene OPN3, Length 1,961 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-204ENST00000469376 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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OPN3-204ENST00000469376 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
OPN3-204ENST00000469376 C10orf71Q711Q0 1435 aa29.28■■■□□ 2.28
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OPN3-204ENST00000469376 GPSM2P81274 684 aa29.22■■■□□ 2.27
OPN3-204ENST00000469376 PAK1Q13153 545 aa29.22■■■□□ 2.27
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OPN3-204ENST00000469376 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
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OPN3-204ENST00000469376 TMTC1Q8IUR5 882 aa29.21■■■□□ 2.27
OPN3-204ENST00000469376 KAT14Q9H8E8 782 aa29.21■■■□□ 2.27
OPN3-204ENST00000469376 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
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OPN3-204ENST00000469376 MTRQ99707 1265 aa29.19■■■□□ 2.26
OPN3-204ENST00000469376 PODXL2Q9NZ53 605 aa29.19■■■□□ 2.26
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