RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436744.2

NICN1-204, Transcript of nicolin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NICN1, Length 1,271 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1-204ENST00000436744 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 ZBED9Q6R2W3 1325 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 MCM3APO60318 1980 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 ADCY6O43306 1168 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 ATP5JP18859 108 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 DNAJB2P25686 324 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 KCNA10Q16322 511 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 SLF1Q9BQI6 1058 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 COG6Q9Y2V7 657 aa20.58■□□□□ 0.89
NICN1-204ENST00000436744 CPXCR1Q8N123 301 aa20.57■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.883e-6■■■■□ 22
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NICN1-204ENST00000436744 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 UBE3CQ15386 1083 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 KLHDC9Q8NEP7 349 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 DDX11Q96FC9 970 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 CHD7Q9P2D1 2997 aa20.56■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 DCDC2CA8MYV0 355 aa20.55■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 HMMRO75330 724 aa20.55■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 NDUFB10O96000 172 aa20.55■□□□□ 0.88
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NICN1-204ENST00000436744 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa20.55■□□□□ 0.88
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NICN1-204ENST00000436744 MYO9BQ13459 2157 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 F5H6K3 240 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 RAB11FIP3O75154 756 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TIMP1P01033 207 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 COPB2P35606 906 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 KLRC3Q07444 240 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TOX2Q96NM4 488 aa20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 REV3LO60673 3130 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 MOXD2PA6NHM9 499 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 MINDY4BA8MYZ0 360 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ACRP10323 421 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 NUP133Q8WUM0 1156 aa20.53■□□□□ 0.88
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NICN1-204ENST00000436744 KIFC2Q96AC6 838 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 TIFAQ96CG3 184 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ZNF576Q9H609 170 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 MYH4Q9Y623 1939 aa20.53■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 PRDM1O75626 825 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ASGR1P07306 291 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 PTGS1P23219 599 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 ACVR2BQ13705 512 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 VTI1AQ96AJ9 217 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 CHMP4CQ96CF2 233 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 CLIP2Q9UDT6 1046 aa20.52■□□□□ 0.88
NICN1-204ENST00000436744 GSG1L2A8MUP6 293 aa20.51■□□□□ 0.87
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NICN1-204ENST00000436744 CCDC144BQ3MJ40 725 aa20.51■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 TMEM240Q5SV17 173 aa20.51■□□□□ 0.87
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NICN1-204ENST00000436744 GLT1D1Q96MS3 346 aa20.51■□□□□ 0.87
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NICN1-204ENST00000436744 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 HOMER2Q9NSB8 354 aa20.51■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 CDK7P50613 346 aa20.5■□□□□ 0.87
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NICN1-204ENST00000436744 ARMCX2Q7L311 632 aa20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 ANKRD35Q8N283 1001 aa20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 OSBP2Q969R2 916 aa20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 NYAP2Q9P242 653 aa20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 DDX19BQ9UMR2 479 aa20.5■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.49■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 ZBED4O75132 1171 aa20.49■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.49■□□□□ 0.87
NICN1-204ENST00000436744 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa20.49■□□□□ 0.87
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