RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435991.2

TRAPPC13P1-201, Transcript of trafficking protein particle complex 13 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene TRAPPC13P1, Length 1,062 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NRDCO43847 1150 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INHBBP09529 407 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RPL10P27635 214 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SOGA3Q5TF21 947 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 OVOS1Q6IE37 1185 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 WAPLQ7Z5K2 1190 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF654Q8IZM8 581 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FOXP3Q9BZS1 431 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EHMT1Q9H9B1 1298 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CAPN10Q9HC96 672 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRTAC1Q9NQ79 661 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCFL5Q9UL49 500 aa7.45□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM82A0PJX8 343 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USP2O75604 605 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EFEMP2O95967 443 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CCNFP41002 786 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMC3Q7Z5M5 1100 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZMYM5Q9UJ78 669 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GALK1P51570 392 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 BBS9Q3SYG4 887 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM132EQ6IEE7 984 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SPATA32Q96LK8 384 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TINF2Q9BSI4 451 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCANO14594 1321 aa7.43□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIGLEC6O43699 453 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CRKP46108 304 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF385BQ569K4 471 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADGRF1Q5T601 910 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ATG4CQ96DT6 458 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HHIPL1Q96JK4 782 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GMLQ99445 158 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRRG2O14669 202 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRAMEF1O95521 474 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SLC14A2Q15849 920 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CEP128Q6ZU80 1094 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NLRC3Q7RTR2 1065 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIRT2Q8IXJ6 389 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SGPP1Q9BX95 441 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MBD1Q9UIS9 605 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KCTD3Q9Y597 815 aa7.41□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 MEIS3P2A8K0S8 358 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 B8ZZF3 427 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RFXAPO00287 272 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLEC3AO75596 197 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SYPP08247 313 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PNLIPP16233 465 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HOXA5P20719 270 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ARID5AQ03989 594 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 USP48Q86UV5 1035 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRDM14Q9GZV8 571 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CTSWP56202 376 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CLCQ05315 142 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TCERG1LQ5VWI1 586 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TMEM151BQ8IW70 566 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PARD6AQ9NPB6 346 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 CHST7Q9NS84 486 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 GGT7Q9UJ14 662 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 TNFRSF10CO14798 259 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FKTNO75072 461 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 NME1P15531 152 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ERVFRD-1P60508 538 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 YBX1P67809 324 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SSPNQ14714 243 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SEZ6Q53EL9 994 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZPBP2Q6X784 338 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SIGLEC10Q96LC7 697 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 C20orf173Q96LM9 149 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ACBD3Q9H3P7 528 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 PRR13Q9NZ81 148 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 UBP1Q9NZI7 540 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 FADS2P1A8MWK0 482 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 ZNF165P49910 485 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 RTP1P59025 263 aa7.37□□□□□ -1.23
TRAPPC13P1-201ENST00000435991 APOBRQ0VD83 1088 aa7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms