RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424350.5

ANKRD54-206, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

TSL 3

Gene ANKRD54, Length 597 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-206ENST00000424350 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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ANKRD54-206ENST00000424350 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54-206ENST00000424350 SH2D4AQ9H788 454 aa20.24■□□□□ 0.83
ANKRD54-206ENST00000424350 MCM9Q9NXL9 1143 aa20.24■□□□□ 0.83
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ANKRD54-206ENST00000424350 ICA1Q05084 483 aa20.22■□□□□ 0.83
ANKRD54-206ENST00000424350 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.22■□□□□ 0.83
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ANKRD54-206ENST00000424350 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa20.21■□□□□ 0.83
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ANKRD54-206ENST00000424350 GPR37L1O60883 481 aa20.2■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.2■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa20.2■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 COG5Q9UP83 839 aa20.19■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 SURF6O75683 361 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-206ENST00000424350 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
ANKRD54-206ENST00000424350 CCL23P55773 120 aa20.18■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa20.17■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
ANKRD54-206ENST00000424350 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.16■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 TEX13BQ9BXU2 312 aa20.16■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-206ENST00000424350 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
ANKRD54-206ENST00000424350 WNT8AQ9H1J5 351 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 RIPK3Q9Y572 518 aa20.15■□□□□ 0.82
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ANKRD54-206ENST00000424350 BCAR3O75815 825 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 CA3P07451 260 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 TMEM67Q5HYA8 995 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 KRT40Q6A162 431 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 HLA-CQ95604 372 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 GOPCQ9HD26 462 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 TNNQ9UQP3 1299 aa20.14■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 LRRC37A2A6NM11 1700 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 TRIM27P14373 513 aa20.13■□□□□ 0.81
ANKRD54-206ENST00000424350 PDE6AP16499 860 aa20.13■□□□□ 0.81
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