RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000377327.8

CRNKL1-201, Transcript of crooked neck pre-mRNA splicing factor 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CRNKL1, Length 4,370 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1-201ENST00000377327 HDAC6Q9UBN7 1215 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 LCMT1Q9UIC8 334 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ATP2A1O14983 1001 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PPP2R5EQ16537 467 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MUM1Q2TAK8 710 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SEL1L2Q5TEA6 688 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 WDR66Q8TBY9 1149 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MGARPQ8TDB4 240 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 DPH5Q9H2P9 285 aa10.01□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TULP2O00295 520 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SUN1O94901 812 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PARP9Q8IXQ6 854 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CCHCR1Q8TD31 782 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 IQGAP3Q86VI3 1631 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CETN3O15182 167 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MMP1P03956 469 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CTNNA2P26232 953 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PROSER3Q2NL68 480 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TCP11X2Q5H9J9 407 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 RASGRP2Q7LDG7 609 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 FAM212AQ96EL1 285 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 GBP5Q96PP8 586 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TUBE1Q9UJT0 475 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ATP7BP35670 1465 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 GMNCA6NCL1 334 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SASH3O75995 380 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MOCS3O95396 460 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 STX2P32856 288 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NR5A1Q13285 461 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SHC4Q6S5L8 630 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NLRP14Q86W24 1093 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SPATA24Q86W54 205 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CCDC65Q8IXS2 484 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PAGE5Q96GU1 130 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 HPCAL4Q9UM19 191 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TSPY3P0CV98 308 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TSPY8P0CW00 308 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 IFNAR2P48551 515 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PACS2Q86VP3 889 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SYCP3Q8IZU3 236 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ANKRD42Q8N9B4 389 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MCUR1Q96AQ8 359 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 HOMER2Q9NSB8 354 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 E9PCH4 1651 aa10□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MADDQ8WXG6 1647 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SETSIPP0DME0 302 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 IFNAR1P17181 557 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CLUL1Q15846 466 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CABP7Q86V35 215 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ERMNQ8TAM6 284 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 NBPF4Q96M43 638 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PNKPQ96T60 521 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PARP2Q9UGN5 583 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 AMFRQ9UKV5 643 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 SHROOM2Q13796 1616 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 LRRC7Q96NW7 1537 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 IGSF1Q8N6C5 1336 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PPP1R37O75864 691 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 RPL13P26373 211 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 ZNF131P52739 623 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 BIRC2Q13490 618 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CCDC93Q567U6 631 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MB21D1Q8N884 522 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 OSBP2Q969R2 916 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 FAM89AQ96GI7 184 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 EPSTI1Q96J88 318 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 TRIM4Q9C037 500 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 GPR108Q9NPR9 543 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 PRDM1O75626 825 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 DRP2Q13474 957 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 FAM133BQ5BKY9 247 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 FYB2Q5VWT5 728 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MSANTD4Q8NCY6 345 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CEP63Q96MT8 703 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 MMS19Q96T76 1030 aa9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 DYMQ7RTS9 669 aa9.98□□□□□ -0.81
CRNKL1-201ENST00000377327 GSTA5Q7RTV2 222 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82 ms