RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 ZMYM6O95789 1325 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TERF1P54274 439 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 GNG11P61952 73 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 NDC80O14777 642 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC14Q49A88 953 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 VWA3BQ502W6 1294 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 NLRP7Q8WX94 980 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CCDC114Q96M63 670 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ANTXR1Q9H6X2 564 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 KCNH4Q9UQ05 1017 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CDK8P49336 464 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 GABPAQ06546 454 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 FBXO40Q9UH90 709 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CLTCL1P53675 1640 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 DPEP1P16444 411 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 FAM160A1Q05DH4 1040 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 M0R2C6 588 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 OR52Z1P0C646 297 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CYP2J2P51589 502 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 RASA3Q14644 834 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PPP2R5AQ15172 486 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 EXOC8Q8IYI6 725 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TXNDC16Q9P2K2 825 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 FAM169AQ9Y6X4 670 aa11.94□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ZBBXA8MT70 800 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 INO80B-WBP1J3KQ70 363 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 KLHL40Q2TBA0 621 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PTCH1Q13635 1447 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TLR3O15455 904 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CYP4A11Q02928 519 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 USP17L10C9JJH3 530 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 UVSSAQ2YD98 709 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 DCUN1D2Q6PH85 259 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 USP17L2Q6R6M4 530 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 LINC00116Q8NCU8 138 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SLF1Q9BQI6 1058 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ELP3Q9H9T3 547 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 STIM2Q9P246 746 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 GLI2P10070 1586 aa11.93□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PAK1Q13153 545 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 RNF207Q6ZRF8 634 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 FAM178BQ8IXR5 827 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ST7Q9NRC1 585 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SPOPO43791 374 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 JAK2O60674 1132 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ADD1P35611 737 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PTH1RQ03431 593 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 SPP2Q13103 211 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PIGSQ96S52 555 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 KRT86O43790 486 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 HSPA4P34932 840 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 E7EVH7 732 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 BCRP11274 1271 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TYRO3Q06418 890 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 GTF3C6Q969F1 213 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CRAMP1Q96RY5 1269 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 STK10O94804 968 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ERCC3P19447 782 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ASIC2Q16515 512 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PRR5LQ6MZQ0 368 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 TMCO3Q6UWJ1 677 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 MAATS1Q7Z4T9 603 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 METTL23Q86XA0 190 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 INCENPQ9NQS7 918 aa11.92□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CAPN9O14815 690 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 ODR4Q5SWX8 454 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CDHR2Q9BYE9 1310 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.91□□□□□ -0.5
PTPRK-205ENST00000368213 GNAT1P11488 350 aa11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 103.9 ms