RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000351328.7

CS-201, Transcript of citrate synthase, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 2,975 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-201ENST00000351328 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MAP3K11Q16584 847 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MFSD6Q6ZSS7 791 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 DRC1Q96MC2 740 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RMI1Q9H9A7 625 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MKNK2Q9HBH9 465 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TOMM22Q9NS69 142 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SIPA1L1O43166 1804 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 FAM196BA6NMK8 535 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 PHF20L1A8MW92 1017 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CTIFO43310 598 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ORC4O43929 436 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CDKL5O76039 1030 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CELF2O95319 508 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SLURP2P0DP57 97 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SHMT1P34896 483 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 IFT88Q13099 833 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ARMC9Q7Z3E5 817 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CCDC26Q8TAB7 109 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MORC4Q8TE76 937 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 KLRG1Q96E93 195 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CCDC17Q96LX7 622 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SLX1AQ9BQ83 275 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TRAIPQ9BWF2 469 aa8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP8□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SSC5DA1L4H1 1573 aa8□□□□□ -1.13
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CS-201ENST00000351328 UNCXA6NJT0 531 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 KIF5CO60282 957 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TPM1P09493 284 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 IREB2P48200 963 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CST9Q5W186 159 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MAMSTRQ6ZN01 415 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 STK11IPQ8N1F8 1099 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SLC44A5Q8NCS7 719 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CNNM2Q9H8M5 875 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ZNF408Q9H9D4 720 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TACC3Q9Y6A5 838 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 E7EWF7 191 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RASA1P20936 1047 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.134e-10■■□□□ 11.6
CS-201ENST00000351328 USP8P40818 1118 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 KRT32Q14532 448 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RASEFQ8IZ41 740 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 C2orf69Q8N8R5 385 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP7.99□□□□□ -1.134e-7■■■□□ 18.4
CS-201ENST00000351328 SPATA32Q96LK8 384 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 KRT23Q9C075 422 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 INCENPQ9NQS7 918 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 GINM1Q9NU53 330 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 LAMA4Q16363 1823 aa7.99□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CAP2P40123 477 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MAGEA9P43362 315 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MAP3K9P80192 1104 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 PRKG1Q13976 671 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SLC5A9Q2M3M2 681 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 WRNIP1Q96S55 665 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 FAM53CQ9NYF3 392 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 SNX14Q9Y5W7 946 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TAF6LQ9Y6J9 622 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TRPM7Q96QT4 1865 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 PRDM1O75626 825 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 NCOA7Q8NI08 942 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ESR2Q92731 530 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 IL17RAQ96F46 866 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 FZD1Q9UP38 647 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 NEDD4P46934 1319 aa7.98□□□□□ -1.13
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CS-201ENST00000351328 PDIA5Q14554 519 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ABCB5Q2M3G0 1257 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CABP5Q9NP86 173 aa7.98□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 CBFA2T2O43439 604 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 KIF4AO95239 1232 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 ASNSP08243 561 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 INPP5BP32019 993 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 PRPHP41219 470 aa7.97□□□□□ -1.13
CS-201ENST00000351328 TFAP4Q01664 338 aa7.97□□□□□ -1.13
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