RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030660.8

Trappc3-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Trap1aP19473 224 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PcQ05920 1178 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Samd11Q1RNF8 542 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ces3aQ63880 571 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ubxn10Q8BG34 277 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Hsdl1Q8BTX9 330 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pus7lQ8CE46 702 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ces3bQ8VCU1 571 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ankrd54Q91WK7 299 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ccdc81Q9D5W4 654 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mlh1Q9JK91 760 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Astn1Q61137 1302 aa20.15■□□□□ 0.82
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rbm8a2A0A0N4SUH6 174 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gm30191A0A0U1RNT7 187 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cst8P32766 142 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nkx1-2P42580 305 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Dnajc2P54103 621 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Zbtb7bQ64321 544 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Usp44Q8C2S0 711 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rbm8aQ9CWZ3 174 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Maged1Q9QYH6 775 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ak2Q9WTP6 239 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nek4Q9Z1J2 792 aa20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 IkQ9Z1M8 557 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pdia3P27773 505 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PtpreP49446 699 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rnf216P58283 853 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 StamP70297 548 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cdc14aQ6GQT0 603 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Slc44a1Q6X893 653 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fbxo10Q7TQF2 950 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fsd2Q8BZ52 692 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Iws1Q8C1D8 766 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rhobtb2Q91V93 728 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PfasQ5SUR0 1337 aa20.13■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ankrd35E9Q9D8 996 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sept4P28661 478 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Bach1P97302 739 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Esyt3Q5DTI8 891 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ifit2Q64112 472 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Wbp1lQ8BGW2 348 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 MslnlQ8C160 685 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pcdhgc5Q91XW9 944 aa20.12■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 NfkbieO54910 364 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Klrb1bP27812 223 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Lpar1P61793 364 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pla2g6P97819 807 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Scg2Q03517 617 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Armc6Q8BNU0 468 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ddx50Q99MJ9 734 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Znf687Q9D2D7 1237 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 KnstrnQ9D9Z1 312 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 GraspQ9JJA9 392 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Kmt2eQ3UG20 1868 aa20.11■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mia3Q8BI84 1930 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nfx1B1AY10 1114 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Map7O88735 730 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sec23aQ01405 765 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Muc1Q02496 630 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Peg10Q7TN75 958 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Zdhhc15Q8BGJ0 337 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tcp11l1Q8BTG3 509 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Terb1Q8C0V1 768 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Smoc2Q8CD91 447 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Oxnad1Q8VE38 311 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Twf2Q9Z0P5 349 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Myh8P13542 1937 aa20.1■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Dnaaf5B9EJR8 853 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tmem63bQ3TWI9 832 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rasip1Q3U0S6 961 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 LrmpQ60664 539 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pramel7Q810Y8 479 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fam126bQ8C729 530 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa20.09■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nlrc5C3VPR6 1915 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pramef17A2ASJ1 475 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 E030030I06RikJ3QML9 246 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Trdmt1O55055 415 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 NfibP97863 570 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Eepd1Q3TGW2 569 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gpbp1l1Q6NZP2 473 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 C2cd5Q7TPS5 1016 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sap130Q8BIH0 1057 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gpcpd1Q8C0L9 675 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 9230110C19RikQ8CC70 267 aa20.08■□□□□ 0.81
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mx1P09922 631 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 CenpbP27790 599 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Irs1P35569 1233 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Kifap3P70188 793 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 1700013D24RikQ0P521 120 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PomkQ3TUA9 349 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mdh1bQ5F204 500 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Znf618Q80YY7 953 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cdkn2aipQ8BI72 563 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PdgfcQ8CI19 345 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 CenppQ9CZ92 286 aa20.07■□□□□ 0.8
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Adgrf4Q9D2L6 698 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.7 ms